More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3248 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  56.49 
 
 		 623 aa  710    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  60.69 
 
 		 613 aa  749    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  60.59 
 
 		 636 aa  771    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  59.38 
 
 		 614 aa  739    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  61.03 
 
 		 604 aa  719    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  56.74 
 
 		 649 aa  710    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 617 aa  1243    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  51.34 
 
 		 612 aa  608  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2488  excinuclease ABC subunit C  45.07 
 
 		 716 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820608  normal  0.0424579 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  45.56 
 
 		 677 aa  499  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  43.22 
 
 		 624 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  44.46 
 
 		 707 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  44.7 
 
 		 707 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2582  excinuclease ABC subunit C  44.31 
 
 		 707 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0298778  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  43.85 
 
 		 613 aa  458  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5066  excinuclease ABC, C subunit  43.29 
 
 		 689 aa  458  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  41.43 
 
 		 588 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  43.22 
 
 		 614 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  38.27 
 
 		 607 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  40.68 
 
 		 607 aa  437  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  40.35 
 
 		 607 aa  434  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  41.71 
 
 		 641 aa  435  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  37.88 
 
 		 615 aa  431  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  39.64 
 
 		 607 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  41.01 
 
 		 653 aa  416  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  37.18 
 
 		 625 aa  419  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  40.33 
 
 		 626 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  39.82 
 
 		 665 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  38.21 
 
 		 598 aa  404  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  40.1 
 
 		 607 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  38.69 
 
 		 669 aa  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  40.13 
 
 		 611 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  38.81 
 
 		 601 aa  405  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  37.56 
 
 		 599 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  35.45 
 
 		 620 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  35.56 
 
 		 620 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  38.46 
 
 		 613 aa  395  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  36.5 
 
 		 613 aa  396  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  36.8 
 
 		 610 aa  398  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  37.52 
 
 		 626 aa  395  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  39.23 
 
 		 622 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  40.23 
 
 		 611 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  39.37 
 
 		 609 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  37.64 
 
 		 617 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1777  excinuclease ABC, C subunit  40.26 
 
 		 636 aa  391  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0413401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  38.55 
 
 		 596 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  37.64 
 
 		 617 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  38.03 
 
 		 617 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  38.55 
 
 		 594 aa  388  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  40.64 
 
 		 610 aa  386  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  38.23 
 
 		 594 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  38.23 
 
 		 594 aa  388  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  38.23 
 
 		 594 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  38.23 
 
 		 594 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  38.46 
 
 		 613 aa  388  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  38.23 
 
 		 594 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  35.22 
 
 		 644 aa  384  1e-105  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  35.61 
 
 		 625 aa  383  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  38.55 
 
 		 594 aa  385  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  39.01 
 
 		 599 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  34.29 
 
 		 613 aa  385  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  37.9 
 
 		 594 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  38.23 
 
 		 594 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  38.86 
 
 		 591 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  35.16 
 
 		 628 aa  382  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  36.79 
 
 		 593 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  38.06 
 
 		 594 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  35.15 
 
 		 638 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  38.09 
 
 		 590 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  38.72 
 
 		 616 aa  375  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1334  excinuclease ABC subunit C  38.76 
 
 		 609 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000285239  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1437  excinuclease ABC subunit C  36.44 
 
 		 609 aa  375  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0535013  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  38.35 
 
 		 619 aa  375  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1276  excinuclease ABC subunit C  38.6 
 
 		 609 aa  373  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00138903  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  38.08 
 
 		 708 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  35.1 
 
 		 604 aa  372  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1403  excinuclease ABC subunit C  42.01 
 
 		 614 aa  372  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.252536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  34.43 
 
 		 685 aa  372  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  39.37 
 
 		 607 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  37.06 
 
 		 623 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2316  excinuclease ABC subunit C  36.6 
 
 		 645 aa  367  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.682688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2449  excinuclease ABC subunit C  36.41 
 
 		 608 aa  368  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0823614  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  37.6 
 
 		 610 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  37.06 
 
 		 623 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2312  excinuclease ABC subunit C  39.06 
 
 		 623 aa  369  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.136814 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  37.44 
 
 		 610 aa  365  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  37.44 
 
 		 610 aa  364  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  39.24 
 
 		 607 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  37.44 
 
 		 610 aa  364  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  37.44 
 
 		 610 aa  364  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  37.44 
 
 		 610 aa  364  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  37.44 
 
 		 610 aa  364  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  39.51 
 
 		 644 aa  363  4e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  38.1 
 
 		 610 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  37.3 
 
 		 623 aa  363  6e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  39.37 
 
 		 607 aa  363  6e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  36.66 
 
 		 628 aa  363  7.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  35.24 
 
 		 609 aa  363  7.0000000000000005e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2220  excinuclease ABC subunit C  38.59 
 
 		 639 aa  362  1e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0021269  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  37.93 
 
 		 610 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>