More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3242 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  100 
 
 		 452 aa  915    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  57.85 
 
 		 446 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  56.88 
 
 		 448 aa  488  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  54.32 
 
 		 448 aa  477  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  56.36 
 
 		 464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  52.46 
 
 		 448 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  52.23 
 
 		 448 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  41.33 
 
 		 453 aa  352  7e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  44.15 
 
 		 451 aa  351  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  35.94 
 
 		 455 aa  342  7e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  43.02 
 
 		 457 aa  337  3.9999999999999995e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  38.93 
 
 		 452 aa  333  4e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  41.39 
 
 		 452 aa  333  5e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  43.27 
 
 		 451 aa  332  8e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  40.04 
 
 		 452 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  39.73 
 
 		 452 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  38.93 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  41.99 
 
 		 449 aa  324  3e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  38.37 
 
 		 449 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  39.11 
 
 		 453 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  39.69 
 
 		 449 aa  311  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  40.36 
 
 		 444 aa  307  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  38.89 
 
 		 468 aa  301  1e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  36.51 
 
 		 440 aa  301  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  38.11 
 
 		 446 aa  299  5e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  39.24 
 
 		 443 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  37.39 
 
 		 451 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  37.39 
 
 		 451 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  38.7 
 
 		 451 aa  295  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  34.75 
 
 		 444 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  35.1 
 
 		 444 aa  290  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  34.82 
 
 		 444 aa  288  9e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  35.1 
 
 		 444 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  35.18 
 
 		 444 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  35.18 
 
 		 444 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  35.18 
 
 		 444 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  36.93 
 
 		 430 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  36.22 
 
 		 447 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  35.18 
 
 		 444 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  35.18 
 
 		 444 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  34.22 
 
 		 456 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  34.96 
 
 		 444 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  34.73 
 
 		 444 aa  286  5e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  34.38 
 
 		 444 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  33.48 
 
 		 442 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  32.58 
 
 		 442 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  39.56 
 
 		 453 aa  278  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  32.17 
 
 		 462 aa  275  9e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  33.86 
 
 		 437 aa  266  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  35.96 
 
 		 432 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  35.32 
 
 		 438 aa  260  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  38.88 
 
 		 450 aa  260  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0804  sun protein  39.29 
 
 		 445 aa  259  9e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0103148 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  39.78 
 
 		 439 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  35.32 
 
 		 438 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1575  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  39.21 
 
 		 445 aa  258  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  34.84 
 
 		 438 aa  256  8e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  38.99 
 
 		 432 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  37.17 
 
 		 501 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  30.54 
 
 		 435 aa  245  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  35.41 
 
 		 431 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  34.98 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185655  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  36.73 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  31.1 
 
 		 435 aa  242  9e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  31.1 
 
 		 435 aa  242  9e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  35.61 
 
 		 438 aa  240  5e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1107  sun protein  35.47 
 
 		 471 aa  239  5e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0019  Sun protein  34.72 
 
 		 445 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  35.93 
 
 		 448 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0728  sun protein  34.9 
 
 		 449 aa  237  4e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0561  sun protein  37 
 
 		 412 aa  236  8e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.494153 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0179  sun protein  37.41 
 
 		 448 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  35.54 
 
 		 427 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0664  Fmu (Sun) domain protein  35.24 
 
 		 430 aa  231  3e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  35.98 
 
 		 426 aa  229  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  33.03 
 
 		 440 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  38.67 
 
 		 436 aa  228  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  36.03 
 
 		 427 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  35.94 
 
 		 447 aa  227  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  33.41 
 
 		 462 aa  226  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0015  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  38.44 
 
 		 436 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0208773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  34.74 
 
 		 445 aa  224  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  36.02 
 
 		 451 aa  224  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  35.82 
 
 		 429 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0085  sun protein  38.01 
 
 		 436 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0018  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  37.47 
 
 		 434 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.577785  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  34.92 
 
 		 442 aa  224  3e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  35.42 
 
 		 425 aa  223  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  37.01 
 
 		 429 aa  223  7e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0017  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  38.31 
 
 		 448 aa  222  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  35.96 
 
 		 431 aa  222  9e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  35.02 
 
 		 436 aa  222  9e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0066  sun protein  37.77 
 
 		 436 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000506957 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00150  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  39.56 
 
 		 443 aa  222  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  35.34 
 
 		 429 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  34.62 
 
 		 429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  34.62 
 
 		 429 aa  221  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  34.62 
 
 		 429 aa  221  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  34.62 
 
 		 429 aa  221  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0082  sun protein  37.53 
 
 		 436 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.254701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>