23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3202 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3202  MFS transporter xanthine/uracil permease  100 
 
 
518 aa  1012    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3148  sulphate transporter  50.1 
 
 
535 aa  412  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217521  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04862  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family protein  47.74 
 
 
533 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2707  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.79 
 
 
527 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.458027 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1746  hypothetical protein  37.18 
 
 
519 aa  262  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00122276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2657  hypothetical protein  35.37 
 
 
526 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728518  normal  0.0923738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4444  xanthine/uracil/vitamin C permease  32.63 
 
 
501 aa  249  8e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2766  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.05 
 
 
530 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2810  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.05 
 
 
530 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.201855 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3054  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.27 
 
 
533 aa  246  9e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.951228  normal  0.199376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6447  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.3 
 
 
530 aa  243  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321531  normal  0.122542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2756  hypothetical protein  32.04 
 
 
551 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0733  xanthine/uracil/vitamin C permease  32.37 
 
 
596 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949342 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18531  permease  32.89 
 
 
533 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.632317 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2322  hypothetical protein  31.3 
 
 
589 aa  220  5e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3142  xanthine/uracil/vitamin C permease  30.92 
 
 
514 aa  219  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.097798  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2028  Xanthine/uracil/vitamin C permease  31.65 
 
 
528 aa  219  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0712084  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0005  hypothetical protein  32.18 
 
 
531 aa  206  9e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.528166  normal  0.285686 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13078  predicted protein  26.5 
 
 
480 aa  162  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10988  predicted protein  26.99 
 
 
444 aa  152  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03660  hypothetical protein  24.9 
 
 
497 aa  140  7.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119535  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  24.8 
 
 
531 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0281  Xanthine/uracil/vitamin C permease  26.06 
 
 
436 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>