100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3141 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  100 
 
 
460 aa  943  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  71.34 
 
 
464 aa  689  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  54.43 
 
 
447 aa  522  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3551  hypothetical protein  54.74 
 
 
371 aa  420  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2993  hypothetical protein  51.9 
 
 
368 aa  398  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  33.6 
 
 
384 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  33.6 
 
 
392 aa  206  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  33.6 
 
 
392 aa  206  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  33.6 
 
 
392 aa  206  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  33.6 
 
 
392 aa  206  7e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  33.6 
 
 
384 aa  206  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  33.6 
 
 
392 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  33.42 
 
 
386 aa  200  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4193  domain of unknown function DUF1745  34.32 
 
 
386 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  32.37 
 
 
386 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  31.3 
 
 
382 aa  176  9e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2724  domain of unknown function DUF1745  29.52 
 
 
374 aa  174  2e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43445  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1939  hypothetical protein  29.35 
 
 
384 aa  174  2e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  32.35 
 
 
389 aa  173  7e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2538  hypothetical protein  29.95 
 
 
382 aa  172  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  31.43 
 
 
400 aa  172  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1925  hypothetical protein  32.37 
 
 
398 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.795435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2201  domain of unknown function DUF1745  32.37 
 
 
398 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3617  hypothetical protein  30.97 
 
 
378 aa  167  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0308687  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3320  hypothetical protein  30.27 
 
 
387 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38990  hypothetical protein  30.54 
 
 
387 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.880326  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2940  hypothetical protein  32.46 
 
 
402 aa  165  1e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00513133 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2479  hypothetical protein  30.29 
 
 
379 aa  165  1e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4519  domain of unknown function DUF1745  30.88 
 
 
387 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317884  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2171  hypothetical protein  28.38 
 
 
387 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  29.05 
 
 
381 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3140  hypothetical protein  27.76 
 
 
387 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2663  hypothetical protein  28.38 
 
 
387 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  28.65 
 
 
382 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3668  hypothetical protein  31.18 
 
 
385 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432885  hitchhiker  0.00253652 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  28.49 
 
 
385 aa  157  5e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2339  domain of unknown function DUF1745  30.13 
 
 
383 aa  156  7e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  28.88 
 
 
389 aa  154  3e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  28.4 
 
 
378 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0700  hypothetical protein  27.85 
 
 
380 aa  142  2e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  0.0832434 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2675  hypothetical protein  28.77 
 
 
399 aa  140  5e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0296571  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1250  hypothetical protein  31.45 
 
 
386 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  31.45 
 
 
386 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1931  hypothetical protein  30.48 
 
 
385 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  27.25 
 
 
392 aa  135  1e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2881  hypothetical protein  28.61 
 
 
390 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1527  hypothetical protein  28.61 
 
 
390 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.039182 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2353  hypothetical protein  26.14 
 
 
393 aa  117  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.18015  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0690  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 
1186 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0982  domain of unknown function DUF1745  27.72 
 
 
666 aa  112  2e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.505903  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5004  chemotaxis sensory transducer  26.74 
 
 
672 aa  109  9e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.71371 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.61 
 
 
669 aa  104  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.39 
 
 
675 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182127  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2083  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.9 
 
 
647 aa  97.4  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0223967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  23.53 
 
 
387 aa  90.1  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1866  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.48 
 
 
650 aa  84.7  3e-15  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  25.75 
 
 
408 aa  76.3  1e-12  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  25.21 
 
 
376 aa  73.6  7e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  8.47515e-09 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  23.5 
 
 
427 aa  71.6  3e-11  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2992  hypothetical protein  50 
 
 
63 aa  70.5  6e-11  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427001  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  26.46 
 
 
400 aa  68.9  2e-10  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  23.36 
 
 
416 aa  66.2  1e-09  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  24.93 
 
 
373 aa  64.3  5e-09  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  27.25 
 
 
417 aa  62.4  1e-08  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1561  hypothetical protein  22.19 
 
 
394 aa  62  2e-08  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0408772  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3552  hypothetical protein  45.9 
 
 
67 aa  60.8  4e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003465  hypothetical protein  23.88 
 
 
393 aa  60.1  8e-08  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  23.56 
 
 
379 aa  59.3  1e-07  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  21 
 
 
934 aa  57.8  4e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02305  hypothetical protein  23.08 
 
 
395 aa  57  8e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  21.21 
 
 
389 aa  55.8  2e-06  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8558  hypothetical protein  22.97 
 
 
398 aa  55.1  3e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3246  domain of unknown function DUF1745  23.48 
 
 
396 aa  54.7  4e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116005  normal  0.61148 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  19.94 
 
 
932 aa  54.3  4e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  20.39 
 
 
512 aa  53.5  8e-06  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  21.2 
 
 
405 aa  53.1  1e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  23.95 
 
 
395 aa  53.1  1e-05  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  23.23 
 
 
933 aa  51.6  3e-05  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3113  hypothetical protein  26.29 
 
 
397 aa  50.8  5e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  hitchhiker  2.08643e-05 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  19.83 
 
 
402 aa  50.1  9e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1891  hypothetical protein  26.7 
 
 
391 aa  50.1  9e-05  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  23.16 
 
 
377 aa  49.3  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  26.46 
 
 
401 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  25 
 
 
395 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  22.77 
 
 
379 aa  48.9  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  24.01 
 
 
375 aa  48.9  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  21.35 
 
 
396 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33222e-19 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  23.21 
 
 
381 aa  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  21.71 
 
 
404 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  21.79 
 
 
396 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0296  hypothetical protein  29.21 
 
 
160 aa  47.4  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2542  hypothetical protein  24.47 
 
 
395 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  21.99 
 
 
931 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3884  domain of unknown function DUF1745  24.13 
 
 
1852 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0615  hypothetical protein  22.82 
 
 
468 aa  45.1  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.948448  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1435  hypothetical protein  21.71 
 
 
501 aa  44.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  25.48 
 
 
365 aa  44.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4241  domain of unknown function DUF1745  22.42 
 
 
411 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  4.32273e-06  hitchhiker  4.52646e-06 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10639  hypothetical protein  27.03 
 
 
383 aa  43.9  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.35133e-15  normal  0.805152 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  19.06 
 
 
396 aa  43.9  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>