More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3078 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3078  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  100 
 
 
369 aa  749    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  64.89 
 
 
365 aa  479  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0915  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  63.59 
 
 
362 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.115848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  62.92 
 
 
363 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2562  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  62.57 
 
 
363 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2806  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  60.78 
 
 
361 aa  430  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1404  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  60.78 
 
 
361 aa  430  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236023 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1993  two component sensor histidine kinase  48.62 
 
 
366 aa  315  8e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4405  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.94 
 
 
363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198423  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  34.84 
 
 
608 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  34.47 
 
 
608 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.47 
 
 
608 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  34.47 
 
 
608 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  34.47 
 
 
608 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  34.47 
 
 
608 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3671  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.67 
 
 
355 aa  210  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4382  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.17 
 
 
363 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.52 
 
 
604 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  33.52 
 
 
604 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4398  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.36 
 
 
351 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.269001 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.43 
 
 
679 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.2 
 
 
598 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67670  two-component sensor NtrB  35.77 
 
 
358 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5858  two-component sensor NtrB  35.5 
 
 
358 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0414  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.4 
 
 
581 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  34.38 
 
 
617 aa  192  8e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  36.57 
 
 
613 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.167481 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
855 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0767  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.99 
 
 
374 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 
362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.13 
 
 
578 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2542  nitrogen regulation protein NR(II)  33.62 
 
 
364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
673 aa  184  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4821  sensor histidine kinase  32.41 
 
 
361 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0015  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.59 
 
 
350 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.327507  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0353  nitrogen regulation protein NtrB  32.41 
 
 
361 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4069  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.65 
 
 
395 aa  179  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.329257 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
586 aa  179  9e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0340  Signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.42 
 
 
361 aa  179  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5047  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.52 
 
 
361 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4922  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.24 
 
 
361 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0416  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.41 
 
 
361 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.994306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5100  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.24 
 
 
361 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
526 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4158  nitrogen regulation protein NR(II)  32.19 
 
 
349 aa  176  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.128409  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3261  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.9 
 
 
355 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
970 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3961  nitrogen regulation protein NR(II)  31.62 
 
 
349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.09 
 
 
546 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  31.07 
 
 
621 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3130  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.01 
 
 
371 aa  172  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0945514  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.52 
 
 
819 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0486  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.33 
 
 
369 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0344418 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0104  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.2 
 
 
367 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2577  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.62 
 
 
390 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00911748  normal  0.381184 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0398  nitrogen regulation protein NR(II)  31.22 
 
 
371 aa  169  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.737334  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 
582 aa  169  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1658  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.9 
 
 
579 aa  169  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0362267  normal  0.337398 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  31.73 
 
 
611 aa  169  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0049  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.38 
 
 
365 aa  169  7e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
525 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2589  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.9 
 
 
390 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206184  normal  0.0145748 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  31.16 
 
 
830 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1444  nitrogen regulation protein ntrB  29.01 
 
 
391 aa  168  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.907164 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.09 
 
 
547 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0735  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.22 
 
 
385 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0331289  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2883  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.9 
 
 
389 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.703794  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1216  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.54 
 
 
357 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2430  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.32 
 
 
420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
525 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
595 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
738 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001907  nitrogen regulation protein NR(II)  31.73 
 
 
348 aa  166  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3046  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.58 
 
 
377 aa  166  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2862  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.62 
 
 
390 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2819  PAS sensor protein  32.58 
 
 
377 aa  166  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.295885  normal  0.569504 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45890  histidine protein kinase, nitrogen regulation protein NtrB (NR(II))  31.2 
 
 
361 aa  166  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  37.86 
 
 
458 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03754  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with GlnG  30.29 
 
 
349 aa  166  8e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4117  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.29 
 
 
349 aa  166  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5315  nitrogen regulation protein NR(II)  30.29 
 
 
349 aa  166  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.962522  normal  0.565649 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4096  nitrogen regulation protein NR(II)  30.29 
 
 
349 aa  166  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4391  nitrogen regulation protein NR(II)  30.29 
 
 
349 aa  166  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.132536  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03703  hypothetical protein  30.29 
 
 
349 aa  166  8e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1836  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.23 
 
 
391 aa  166  8e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.058268  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4504  nitrogen regulation protein NR(II)  30.77 
 
 
349 aa  166  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4147  nitrogen regulation protein NR(II)  30.29 
 
 
349 aa  166  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  29.1 
 
 
550 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  37.45 
 
 
458 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2320  nitrogen regulation protein NR(II)  30.77 
 
 
354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0257  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.4 
 
 
381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  30.14 
 
 
614 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  37.04 
 
 
465 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2937  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.93 
 
 
381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0320992  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  37.45 
 
 
458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  37.45 
 
 
458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  37.45 
 
 
458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  37.45 
 
 
458 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  30.92 
 
 
611 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3650  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.74 
 
 
358 aa  164  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.051036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>