More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3036 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3036  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
258 aa  530  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2198  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  64.2 
 
 
258 aa  336  3e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00658459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2029  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  64.71 
 
 
258 aa  335  6e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57166e-10 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4414  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  63.14 
 
 
256 aa  323  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00164225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3288  thiF family protein  61.51 
 
 
255 aa  312  4e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3237  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  62.45 
 
 
255 aa  305  5e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0154153  normal  0.0391126 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1368  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.59 
 
 
255 aa  249  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.73518e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3014  HesA/MoeB/thiF family protein  53.7 
 
 
252 aa  248  7e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7357e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.21 
 
 
244 aa  236  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00485508  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50 
 
 
242 aa  233  2e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2278  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.84 
 
 
244 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00531511  hitchhiker  7.38809e-07 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.74 
 
 
254 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  8.13417e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3110  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  45.42 
 
 
254 aa  216  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0550  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.61 
 
 
254 aa  212  4e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0761  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.74 
 
 
246 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.78365e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.02 
 
 
253 aa  211  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.72262e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1693  HesA/MoeB/ThiF family protein  47.97 
 
 
249 aa  209  3e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.658136 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0522  HesA/MoeB/ThiF family protein  45.42 
 
 
267 aa  206  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3117  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.59 
 
 
255 aa  205  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  4.96284e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4481  hesA/moeB/thiF family protein  48.59 
 
 
255 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.6452e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4630  hesA/moeB/thiF family protein  48.59 
 
 
255 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  4.45557e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4144  hesA/moeB/thiF family protein  48.59 
 
 
255 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  2.36944e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4484  hesA/moeB/thiF family protein  48.59 
 
 
255 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  6.92664e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4296  hesA/moeB/thiF family protein  48.59 
 
 
255 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  1.13687e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4534  hesA/moeB/thiF family protein  48.59 
 
 
255 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  7.45261e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4521  hesA/moeB/thiF family protein  48.59 
 
 
255 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.82259e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4134  hesA/moeB/thiF family protein  48.59 
 
 
255 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  8.45686e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.83 
 
 
253 aa  202  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594436  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0946  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.71 
 
 
254 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0715  hesA/moeB/thiF family protein  47.79 
 
 
255 aa  199  4e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  9.90791e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4248  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.79 
 
 
255 aa  199  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000534198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3176  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.27 
 
 
257 aa  198  7e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.24 
 
 
246 aa  196  3e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1675  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  42.4 
 
 
242 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.492542  hitchhiker  0.00106049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1086  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.84 
 
 
246 aa  188  7e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2571  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.11 
 
 
243 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.508745  normal  0.0248599 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23710  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  46.06 
 
 
258 aa  185  6e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  3.94678e-05  normal  0.987322 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0064  HesA/MoeB/ThiF family protein  41.43 
 
 
253 aa  184  9e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0067  HesA/MoeB/ThiF family protein  41.43 
 
 
253 aa  184  9e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1719  hypothetical protein  42.64 
 
 
257 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00168619  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1525  ThiF family protein  38.4 
 
 
276 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1686  hypothetical protein  42.64 
 
 
257 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  3.36589e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0073  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.64 
 
 
264 aa  180  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000480961  normal  0.411412 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.44 
 
 
254 aa  180  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  2.51146e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  39.85 
 
 
263 aa  179  3e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002691  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.69 
 
 
269 aa  179  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0813  hypothetical protein  44.58 
 
 
236 aa  179  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000136128  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03292  hypothetical protein  37.31 
 
 
269 aa  179  5e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1191  HesA/MoeB/ThiF family protein  41.86 
 
 
258 aa  177  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.237248  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1898  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.31 
 
 
273 aa  176  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.22 
 
 
272 aa  172  3e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2212  thiF family protein  37.17 
 
 
272 aa  172  4e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4459  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.02 
 
 
259 aa  172  4e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.35994e-07 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2998  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.79 
 
 
275 aa  172  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold-containing protein  37.93 
 
 
302 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0322  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  40.49 
 
 
240 aa  172  6e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0923  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.71 
 
 
270 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2953  ThiF family protein  42.42 
 
 
266 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0973303  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0852  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.54 
 
 
261 aa  169  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0876  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.92 
 
 
268 aa  168  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02663  hypothetical protein  41.92 
 
 
268 aa  168  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2776  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.89 
 
 
237 aa  169  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.183902  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0900  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.92 
 
 
268 aa  168  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2956  ThiF family protein  41.92 
 
 
268 aa  168  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00132  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02624  hypothetical protein  41.92 
 
 
268 aa  168  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3118  ThiF family protein  41.92 
 
 
268 aa  168  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00141325  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3058  ThiF family protein  41.92 
 
 
268 aa  168  8e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0969752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3224  hypothetical protein  35.11 
 
 
275 aa  168  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  normal  0.551633 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3150  ThiF family protein  41.41 
 
 
268 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1048  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.11 
 
 
275 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3809  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.71 
 
 
268 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  5.33838e-05  hitchhiker  5.27658e-07 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39130  ThiF-/MoeB-like protein  40.91 
 
 
270 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.107651  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0546  HesA/MoeB/ThiF family protein  44.33 
 
 
277 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0491251  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3182  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.29 
 
 
277 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1464  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.82 
 
 
242 aa  166  3e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0996  thiF family protein  34.73 
 
 
275 aa  166  3e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0511396  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.67 
 
 
244 aa  166  3e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0002961  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2016  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.27 
 
 
248 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1090  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  39.69 
 
 
270 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2386  HesA/MoeB/ThiF family protein  41.27 
 
 
248 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3213  ThiF family protein  40.91 
 
 
268 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3313  ThiF family protein  40.91 
 
 
268 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.223246  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3199  ThiF family protein  40.91 
 
 
268 aa  165  6e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3133  ThiF family protein  40.91 
 
 
268 aa  165  6e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.852277  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0542  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  44.32 
 
 
264 aa  165  7e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0512  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.44 
 
 
268 aa  164  1e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0818  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.61 
 
 
295 aa  162  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412635  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4077  ThiF family protein  41.41 
 
 
266 aa  162  4e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0251  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.23 
 
 
265 aa  162  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1333  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.78 
 
 
276 aa  161  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.100552 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0688  hypothetical protein  38.22 
 
 
271 aa  159  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0324843  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4197  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.92 
 
 
269 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489561  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06440  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  41.6 
 
 
247 aa  159  5e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.217123 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4092  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.54 
 
 
269 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1527  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.54 
 
 
271 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0678963  normal  0.117289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1136  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.54 
 
 
269 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.761745 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4216  hypothetical protein  38.78 
 
 
270 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0656  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.43 
 
 
255 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0619  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.8 
 
 
244 aa  154  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.19184 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3220  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.64 
 
 
285 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>