More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2954 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  100 
 
 
338 aa  678    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  75.44 
 
 
338 aa  498  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  71.89 
 
 
338 aa  482  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  70.41 
 
 
338 aa  478  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  71.6 
 
 
338 aa  474  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  71.3 
 
 
338 aa  461  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  70.12 
 
 
338 aa  456  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.52 
 
 
426 aa  349  4e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  56.36 
 
 
356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  51.7 
 
 
423 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  57.88 
 
 
348 aa  330  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.85 
 
 
417 aa  329  4e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  53.73 
 
 
353 aa  325  5e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  50.62 
 
 
346 aa  325  7e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  53.89 
 
 
354 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  53.89 
 
 
354 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  51.71 
 
 
427 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  53.59 
 
 
354 aa  318  6e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  54.83 
 
 
419 aa  318  7e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  51.06 
 
 
422 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  52.12 
 
 
387 aa  318  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.17 
 
 
434 aa  316  3e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  56.92 
 
 
423 aa  314  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.58 
 
 
425 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  53.29 
 
 
347 aa  310  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  52.42 
 
 
432 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.87 
 
 
348 aa  309  5e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.87 
 
 
333 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  50.91 
 
 
428 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.17 
 
 
425 aa  306  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  51.35 
 
 
345 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.34 
 
 
336 aa  303  4.0000000000000003e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  49.55 
 
 
370 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  50.46 
 
 
428 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  50.15 
 
 
428 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  49.7 
 
 
428 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  49.39 
 
 
424 aa  301  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  50.15 
 
 
428 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  49.85 
 
 
428 aa  301  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  49.85 
 
 
428 aa  301  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  50.15 
 
 
428 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  49.69 
 
 
341 aa  300  2e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.33 
 
 
369 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.3 
 
 
458 aa  300  2e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  49.85 
 
 
428 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  49.7 
 
 
341 aa  300  3e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.64 
 
 
482 aa  299  4e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  52.58 
 
 
354 aa  299  4e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  49.09 
 
 
427 aa  299  5e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  49.39 
 
 
428 aa  298  6e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  49.09 
 
 
430 aa  299  6e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  49.09 
 
 
430 aa  299  6e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  48.52 
 
 
408 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  48.52 
 
 
408 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  48.82 
 
 
408 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.74 
 
 
340 aa  297  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  49.54 
 
 
365 aa  297  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  50.15 
 
 
365 aa  297  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  49.55 
 
 
358 aa  297  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  48.17 
 
 
430 aa  297  2e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  47.93 
 
 
439 aa  296  2e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.65 
 
 
356 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.28 
 
 
464 aa  296  3e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  48.79 
 
 
337 aa  296  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  51.99 
 
 
362 aa  296  4e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.25 
 
 
342 aa  296  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  48.78 
 
 
428 aa  296  5e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  51.71 
 
 
450 aa  295  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  52.31 
 
 
349 aa  295  8e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  48.92 
 
 
434 aa  295  1e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  48.8 
 
 
337 aa  293  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  47.11 
 
 
402 aa  294  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  49.27 
 
 
353 aa  293  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  50.61 
 
 
397 aa  294  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.85 
 
 
463 aa  294  2e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  47.32 
 
 
440 aa  293  2e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  49.41 
 
 
326 aa  294  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.43 
 
 
429 aa  293  3e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  51.22 
 
 
334 aa  293  3e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2690  GTPase ObgE  50.75 
 
 
366 aa  292  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.931281  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2180  GTPase ObgE  51.38 
 
 
454 aa  292  6e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  50.3 
 
 
379 aa  291  8e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  50.61 
 
 
493 aa  291  9e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  52.58 
 
 
353 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  50.91 
 
 
349 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  49.25 
 
 
407 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  50 
 
 
407 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  51.34 
 
 
356 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  52 
 
 
353 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.4 
 
 
371 aa  291  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  51.07 
 
 
370 aa  290  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.55 
 
 
344 aa  290  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  49.24 
 
 
372 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  47.76 
 
 
327 aa  289  4e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.94 
 
 
343 aa  289  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  47.18 
 
 
408 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  48.35 
 
 
362 aa  289  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  49.69 
 
 
372 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  49.69 
 
 
372 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  49.69 
 
 
372 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>