199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2937 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 411 aa  833    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  60.99 
 
 		 411 aa  502  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  48.06 
 
 		 412 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  46.8 
 
 		 411 aa  364  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  46.8 
 
 		 411 aa  364  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  43.03 
 
 		 412 aa  362  6e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  45.57 
 
 		 410 aa  359  5e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  43.28 
 
 		 411 aa  341  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  43.95 
 
 		 428 aa  333  3e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  43.63 
 
 		 411 aa  333  4e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  42.22 
 
 		 419 aa  326  5e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  44.64 
 
 		 417 aa  303  5.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  35.19 
 
 		 424 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  39.01 
 
 		 448 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  39.62 
 
 		 447 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  33.7 
 
 		 410 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  32.35 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  32.77 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  39.25 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  32.7 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  34.72 
 
 		 405 aa  208  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  36.84 
 
 		 403 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  34.91 
 
 		 422 aa  207  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  30.37 
 
 		 406 aa  200  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  34.14 
 
 		 413 aa  197  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  32.1 
 
 		 407 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  30.43 
 
 		 415 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  32.77 
 
 		 412 aa  193  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  31.71 
 
 		 411 aa  192  9e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  31.45 
 
 		 407 aa  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  31.01 
 
 		 402 aa  189  8e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  32.05 
 
 		 397 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  34.15 
 
 		 416 aa  188  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  32.34 
 
 		 408 aa  188  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  33.99 
 
 		 413 aa  187  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  34.09 
 
 		 423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  31.64 
 
 		 402 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  27.97 
 
 		 413 aa  184  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  32.56 
 
 		 487 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  31.8 
 
 		 404 aa  179  7e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  30.65 
 
 		 406 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  32.7 
 
 		 406 aa  177  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  30.59 
 
 		 397 aa  176  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  28.11 
 
 		 404 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  30.4 
 
 		 408 aa  173  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  27.97 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  30.23 
 
 		 409 aa  171  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  31.12 
 
 		 403 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  30.3 
 
 		 423 aa  169  8e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  31.41 
 
 		 400 aa  168  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  30.3 
 
 		 423 aa  169  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  29.33 
 
 		 404 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  29.63 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  27.41 
 
 		 405 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  28.25 
 
 		 400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  28.46 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  28.65 
 
 		 414 aa  160  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  28.25 
 
 		 431 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  28.5 
 
 		 429 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  29.17 
 
 		 431 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  29.58 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  29.17 
 
 		 431 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  29.64 
 
 		 450 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  28.81 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  29.09 
 
 		 449 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  27.9 
 
 		 464 aa  150  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  26.16 
 
 		 411 aa  149  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  27.79 
 
 		 405 aa  149  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  28.5 
 
 		 460 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  27.63 
 
 		 458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  33.15 
 
 		 423 aa  147  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  31.28 
 
 		 428 aa  146  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  33.42 
 
 		 402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  27.25 
 
 		 480 aa  124  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  22.44 
 
 		 403 aa  123  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  35.64 
 
 		 389 aa  116  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  31.08 
 
 		 439 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  30.03 
 
 		 444 aa  113  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  26.42 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  25.71 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  25.83 
 
 		 407 aa  99.4  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  24.75 
 
 		 397 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  24.19 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  23.82 
 
 		 444 aa  94.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  24.3 
 
 		 414 aa  93.2  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  26.34 
 
 		 379 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  26.34 
 
 		 379 aa  90.9  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  23.79 
 
 		 463 aa  90.1  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  30.22 
 
 		 378 aa  87.4  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  23.02 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  30.92 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  23.26 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2226  diguanylate phosphodiesterase  27.88 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0863855  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2044  putative signal transduction protein  24.09 
 
 		 398 aa  57  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2227  diguanylate phosphodiesterase  25.77 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1902  diguanylate phosphodiesterase  28.68 
 
 		 253 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.570063 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3839  putative signal transduction protein  23.55 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4836  putative diguanylate phosphodiesterase  29.37 
 
 		 254 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252765  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0024  diguanylate phosphodiesterase  30.47 
 
 		 246 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.481277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0026  diguanylate phosphodiesterase  30.47 
 
 		 246 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>