87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2910 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2910  methyltransferase type 11  100 
 
 
252 aa  508  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0055  protein of unknown function DUF323  70.73 
 
 
701 aa  363  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0053  protein of unknown function DUF323  69.11 
 
 
701 aa  353  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000456443 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2978  protein of unknown function DUF323  68.85 
 
 
553 aa  352  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0017  hypothetical protein  65.18 
 
 
702 aa  340  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0386  hypothetical protein  53.6 
 
 
716 aa  276  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172977  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2257  hypothetical protein  51.24 
 
 
726 aa  264  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3577  protein of unknown function DUF323  51.84 
 
 
727 aa  258  6e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0416  protein of unknown function DUF323  53.44 
 
 
702 aa  256  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.592351  hitchhiker  0.000236625 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0240  hypothetical protein  53.44 
 
 
702 aa  256  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1078  protein of unknown function DUF323  51.03 
 
 
700 aa  249  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1543  hypothetical protein  49 
 
 
709 aa  248  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0361  methyltransferase type 12  51.64 
 
 
252 aa  241  7.999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0264  hypothetical protein  47.93 
 
 
699 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0477  hypothetical protein  46.09 
 
 
701 aa  233  3e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3422  hypothetical protein  47.93 
 
 
709 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4465  hypothetical protein  46.28 
 
 
699 aa  232  5e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0265  hypothetical protein  47.72 
 
 
699 aa  231  6e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228556 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0381  hypothetical protein  47.52 
 
 
705 aa  231  9e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3757  hypothetical protein  47.52 
 
 
699 aa  230  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.62382  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0271  protein of unknown function DUF323  47.11 
 
 
704 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0275  hypothetical protein  47.11 
 
 
704 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0267  hypothetical protein  47.11 
 
 
704 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0275  hypothetical protein  47.11 
 
 
704 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1749  protein of unknown function DUF323  37.6 
 
 
696 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44876  predicted protein  34.21 
 
 
933 aa  132  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3663  hypothetical protein  37.37 
 
 
722 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.793757  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2592  hypothetical protein  31.33 
 
 
703 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.249838 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0605  hypothetical protein  32.83 
 
 
747 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1747  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 
280 aa  96.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.044533  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6244  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
326 aa  87  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.099736  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0900  hypothetical protein  33.18 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2572  hypothetical protein  32.38 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.134075  normal  0.851171 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1886  Methyltransferase type 11  29.95 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000470548  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1245  methyltransferase type 11  31.48 
 
 
322 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2700  hypothetical protein  31.94 
 
 
312 aa  68.9  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000485808  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0125  hypothetical protein  30.45 
 
 
339 aa  63.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33230  predicted protein  29.59 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0061924  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  28.19 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  29.1 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  30.6 
 
 
237 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  31.34 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000694  hypothetical protein  23.65 
 
 
259 aa  50.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.35 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  29.85 
 
 
213 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
1106 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  37.84 
 
 
1312 aa  45.8  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  35.53 
 
 
264 aa  45.8  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 
284 aa  45.4  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  37.18 
 
 
273 aa  45.4  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  22.92 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  24.84 
 
 
284 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
1314 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  23.08 
 
 
631 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  26.25 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 
241 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
222 aa  45.4  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 
1162 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  27.15 
 
 
241 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  26.87 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  29.34 
 
 
637 aa  44.3  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  27.37 
 
 
1124 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3569  Methyltransferase type 11  40.79 
 
 
259 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  22.22 
 
 
249 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  29.55 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  27.21 
 
 
266 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0131  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.13 
 
 
253 aa  43.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862077  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  30.43 
 
 
243 aa  43.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 
255 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  29.33 
 
 
353 aa  43.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  28.91 
 
 
289 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  32.35 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  32.35 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  29.17 
 
 
240 aa  42.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  32.35 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  29.01 
 
 
189 aa  42.7  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  25.77 
 
 
258 aa  42.7  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  32.33 
 
 
241 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 
261 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
265 aa  42.4  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.02 
 
 
305 aa  42.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  32.33 
 
 
241 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  23.91 
 
 
213 aa  42  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>