More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2876 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
337 aa  698    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  64.12 
 
 
341 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  64.12 
 
 
341 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  59.64 
 
 
333 aa  425  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  59.05 
 
 
328 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  52.85 
 
 
345 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  51.92 
 
 
345 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  51.03 
 
 
345 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4805  oxidoreductase domain-containing protein  51.04 
 
 
341 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.468504  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  48.35 
 
 
350 aa  364  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  48.21 
 
 
352 aa  357  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  47.89 
 
 
342 aa  350  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3688  oxidoreductase domain-containing protein  45.48 
 
 
339 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.6673  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  42.17 
 
 
363 aa  296  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  41.47 
 
 
387 aa  287  1e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  40.36 
 
 
347 aa  281  9e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  40.83 
 
 
358 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  40 
 
 
370 aa  275  7e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  40.67 
 
 
340 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  37.43 
 
 
364 aa  263  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  37.43 
 
 
371 aa  256  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  34.8 
 
 
315 aa  194  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4431  oxidoreductase domain-containing protein  31.63 
 
 
334 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1139  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 
317 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0785  oxidoreductase domain-containing protein  31 
 
 
345 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1986  oxidoreductase domain protein  31.04 
 
 
344 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0307  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 
351 aa  176  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1531  oxidoreductase domain protein  30.29 
 
 
343 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1558  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
343 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106929  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3200  oxidoreductase domain-containing protein  31.53 
 
 
353 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  33.43 
 
 
335 aa  166  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0798  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  29.06 
 
 
375 aa  166  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  28.4 
 
 
517 aa  155  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  28.4 
 
 
517 aa  153  4e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1859  oxidoreductase domain-containing protein  28.1 
 
 
326 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2215  oxidoreductase-like  28.82 
 
 
344 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462955  normal  0.157266 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  28.66 
 
 
330 aa  142  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.74 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.74 
 
 
318 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1564  oxidoreductase domain-containing protein  27.68 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.41 
 
 
317 aa  127  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 
344 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  28.44 
 
 
361 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  28.32 
 
 
311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  30.92 
 
 
361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  26.65 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.33 
 
 
312 aa  113  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  28.96 
 
 
319 aa  112  9e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1494  oxidoreductase domain-containing protein  26.95 
 
 
329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340546 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  26.67 
 
 
313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  27.57 
 
 
315 aa  105  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  30.94 
 
 
311 aa  103  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  27.6 
 
 
344 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  27.71 
 
 
310 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  25.53 
 
 
320 aa  102  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 
344 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  27.74 
 
 
313 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  27.43 
 
 
332 aa  99.4  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  25.24 
 
 
345 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.61 
 
 
310 aa  97.8  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  27.16 
 
 
344 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  26.89 
 
 
312 aa  95.5  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  25.15 
 
 
327 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  23.43 
 
 
353 aa  94  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  25.71 
 
 
318 aa  94.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  32 
 
 
314 aa  93.2  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 
331 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  25.88 
 
 
328 aa  92.8  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.36 
 
 
319 aa  92.8  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  25.96 
 
 
320 aa  92.8  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  25.96 
 
 
320 aa  92.8  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  23.55 
 
 
359 aa  92.4  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  25.3 
 
 
334 aa  92.4  9e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  24.61 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  28.32 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  26.83 
 
 
344 aa  90.5  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  23.46 
 
 
337 aa  89.7  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  36.43 
 
 
367 aa  89.4  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.59 
 
 
345 aa  89  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.85 
 
 
329 aa  89.4  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  27.41 
 
 
346 aa  89  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.85 
 
 
428 aa  89  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  32.53 
 
 
359 aa  88.6  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  24.7 
 
 
334 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  23.78 
 
 
327 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  27.14 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  32.11 
 
 
346 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  22.77 
 
 
351 aa  87.8  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.81 
 
 
343 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  24.92 
 
 
316 aa  87.8  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  26.69 
 
 
335 aa  87.4  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.81 
 
 
343 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 
338 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  23.78 
 
 
327 aa  87.8  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  31.71 
 
 
385 aa  87.4  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  23.72 
 
 
310 aa  87  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  24.34 
 
 
339 aa  87  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  31.93 
 
 
359 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  31.93 
 
 
359 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  31.93 
 
 
346 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>