More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2774 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  100 
 
 
262 aa  530  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44310  nucleotidyltransferase family protein  57.63 
 
 
247 aa  265  6e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.918845  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  51.68 
 
 
261 aa  248  9e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  54.77 
 
 
256 aa  246  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  53.53 
 
 
246 aa  231  7e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  53.81 
 
 
254 aa  226  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  46.72 
 
 
263 aa  213  2e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  31.91 
 
 
250 aa  115  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  31.62 
 
 
232 aa  104  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  26.97 
 
 
241 aa  102  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  28.79 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
249 aa  93.6  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  30.61 
 
 
243 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  33.88 
 
 
243 aa  89.7  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  32.52 
 
 
243 aa  89  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  25.69 
 
 
249 aa  87.4  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  7.72544e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  32.92 
 
 
243 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  2.88771e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  27.67 
 
 
263 aa  86.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  31.85 
 
 
237 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  28.23 
 
 
247 aa  84.7  1e-15  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  26.59 
 
 
254 aa  83.2  4e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  25 
 
 
247 aa  82.4  8e-15  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  1.4669e-07 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  33.33 
 
 
244 aa  82  9e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  29.92 
 
 
254 aa  80.5  3e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  28.42 
 
 
263 aa  80.1  3e-14  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  32 
 
 
243 aa  77.8  2e-13  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  36.27 
 
 
522 aa  77.4  2e-13  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  26.8 
 
 
244 aa  77.8  2e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  29.51 
 
 
254 aa  76.6  4e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  33.57 
 
 
393 aa  73.9  2e-12  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  29.53 
 
 
556 aa  73.9  2e-12  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 
596 aa  73.9  3e-12  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  32.09 
 
 
564 aa  73.2  4e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  24.8 
 
 
630 aa  72.4  7e-12  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  29.68 
 
 
393 aa  72.4  7e-12  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  33.66 
 
 
592 aa  71.6  1e-11  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  27.81 
 
 
396 aa  71.2  2e-11  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  36.13 
 
 
776 aa  70.9  2e-11  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  28.4 
 
 
254 aa  70.5  3e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  34.06 
 
 
383 aa  70.5  3e-11  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4245  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.09 
 
 
561 aa  70.1  4e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  27.2 
 
 
439 aa  69.7  4e-11  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.09 
 
 
561 aa  70.1  4e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  26.23 
 
 
256 aa  69.7  4e-11  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.09 
 
 
561 aa  69.3  5e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2028  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase-like protein  27.48 
 
 
300 aa  69.3  6e-11  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  1.94318e-05 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3398  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.09 
 
 
561 aa  69.3  6e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4016  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.98 
 
 
562 aa  69.3  7e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213479  normal  0.855206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  25.69 
 
 
561 aa  68.9  8e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  29.33 
 
 
578 aa  68.9  8e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  37.29 
 
 
248 aa  68.9  8e-11  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  27.6 
 
 
230 aa  68.6  9e-11  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  34.51 
 
 
247 aa  68.6  9e-11  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  23.14 
 
 
253 aa  68.6  1e-10  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  27.17 
 
 
401 aa  67.4  2e-10  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  33.01 
 
 
227 aa  67.8  2e-10  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  31.69 
 
 
568 aa  67.8  2e-10  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4470  sugar nucleotidyltransferase-like protein  30.04 
 
 
255 aa  67.4  2e-10  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.75477  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  32.04 
 
 
227 aa  67.4  2e-10  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4471  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.9 
 
 
562 aa  67.4  2e-10  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  26.92 
 
 
393 aa  67.4  2e-10  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  31.82 
 
 
562 aa  67  3e-10  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  29.71 
 
 
400 aa  66.6  3e-10  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  22.75 
 
 
253 aa  67  3e-10  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  31.43 
 
 
393 aa  66.6  4e-10  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  26.7 
 
 
590 aa  66.2  5e-10  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  26.92 
 
 
393 aa  66.2  5e-10  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  30 
 
 
255 aa  65.9  6e-10  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  30 
 
 
255 aa  65.9  6e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  30 
 
 
255 aa  65.9  6e-10  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.69 
 
 
393 aa  65.9  6e-10  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  29.27 
 
 
223 aa  65.9  7e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  30.08 
 
 
260 aa  65.5  8e-10  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  34.78 
 
 
245 aa  65.5  8e-10  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5681  nucleotidyl transferase  29.84 
 
 
242 aa  65.5  9e-10  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  27.45 
 
 
253 aa  64.7  1e-09  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  26.6 
 
 
405 aa  65.1  1e-09  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  28.11 
 
 
251 aa  64.7  1e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.81 
 
 
358 aa  64.7  1e-09  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  29.6 
 
 
255 aa  64.3  2e-09  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  29.88 
 
 
255 aa  64.3  2e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  29.88 
 
 
255 aa  63.9  2e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
384 aa  64.3  2e-09  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  29.6 
 
 
255 aa  64.3  2e-09  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1857  nucleotidyl transferase  27.78 
 
 
220 aa  64.3  2e-09  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58805 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4244  sugar nucleotidyltransferases-like  29.88 
 
 
255 aa  64.3  2e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  29.6 
 
 
255 aa  64.3  2e-09  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  26.54 
 
 
253 aa  64.3  2e-09  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  29.6 
 
 
255 aa  64.3  2e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  32.81 
 
 
232 aa  63.5  3e-09  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  29.86 
 
 
397 aa  63.5  3e-09  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  31.97 
 
 
392 aa  63.5  4e-09  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  28 
 
 
228 aa  63.2  4e-09  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  37.5 
 
 
230 aa  63.2  5e-09  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  1.62703e-05 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  26.62 
 
 
385 aa  62.8  5e-09  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  28.51 
 
 
325 aa  62.8  5e-09  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  28.78 
 
 
393 aa  62.8  5e-09  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  26.86 
 
 
400 aa  62.8  5e-09  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  29.75 
 
 
611 aa  62.4  6e-09  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  9.26703e-05  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>