More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2770 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 584 aa  1194    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  56.34 
 
 		 603 aa  651    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3423  acyl-CoA synthetase  52.01 
 
 		 601 aa  557  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0231  acyl-CoA synthetase  48.59 
 
 		 608 aa  557  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229667  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  46.88 
 
 		 576 aa  526  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  47.06 
 
 		 576 aa  527  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  46.88 
 
 		 576 aa  524  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  46.88 
 
 		 573 aa  523  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  46.88 
 
 		 573 aa  523  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  46.86 
 
 		 563 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1688  acyl-CoA synthetase  49.21 
 
 		 568 aa  505  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  44.33 
 
 		 574 aa  480  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  45.31 
 
 		 585 aa  480  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  45.18 
 
 		 839 aa  479  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  36.26 
 
 		 958 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  36.46 
 
 		 852 aa  306  7e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  36.46 
 
 		 936 aa  304  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 		 577 aa  301  3e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  37.13 
 
 		 1789 aa  294  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  36.19 
 
 		 1779 aa  291  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 		 942 aa  290  6e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  34.92 
 
 		 947 aa  289  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  37.08 
 
 		 958 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  36.72 
 
 		 586 aa  287  5e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  36.48 
 
 		 1776 aa  285  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 		 949 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  36.11 
 
 		 586 aa  283  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  35.98 
 
 		 595 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  34.73 
 
 		 1801 aa  279  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 		 962 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  35.86 
 
 		 586 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4552  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.09 
 
 		 563 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  34.89 
 
 		 1067 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  32.17 
 
 		 2762 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  33.57 
 
 		 4336 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 		 586 aa  266  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  36.02 
 
 		 3208 aa  265  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  33.75 
 
 		 4336 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  33.04 
 
 		 4332 aa  264  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  32.31 
 
 		 1656 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  33.33 
 
 		 4342 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  34.07 
 
 		 4317 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  34.31 
 
 		 614 aa  259  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  33.51 
 
 		 4342 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  34.53 
 
 		 1035 aa  257  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  34.2 
 
 		 586 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 		 579 aa  256  8e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  33.28 
 
 		 6403 aa  256  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  34.9 
 
 		 4317 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  34.92 
 
 		 4318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  31.65 
 
 		 2997 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  31.77 
 
 		 2820 aa  253  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.83 
 
 		 546 aa  253  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  33.33 
 
 		 4317 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  33.03 
 
 		 4317 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  34.35 
 
 		 653 aa  249  7e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  29.42 
 
 		 3718 aa  249  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  33.09 
 
 		 6889 aa  248  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 		 578 aa  248  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  33.94 
 
 		 2250 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  29.98 
 
 		 3099 aa  248  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  32.62 
 
 		 3231 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  32.6 
 
 		 596 aa  246  9e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  32.93 
 
 		 592 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1929  AMP-dependent synthetase and ligase  32.15 
 
 		 648 aa  240  5e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32420  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.74 
 
 		 560 aa  239  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.300153  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  31.37 
 
 		 611 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5617  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.48 
 
 		 544 aa  236  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5217  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.26 
 
 		 544 aa  236  9e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  30.11 
 
 		 725 aa  236  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_003296  RS01920  putative transmembrane protein  33.03 
 
 		 559 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.467911  normal  0.0185745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  29.93 
 
 		 725 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1051  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.9 
 
 		 544 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  31.84 
 
 		 2791 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  32.76 
 
 		 755 aa  233  6e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5237  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.18 
 
 		 544 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0398716  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.18 
 
 		 544 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.256075 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  30.35 
 
 		 597 aa  233  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  30.35 
 
 		 597 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  32.59 
 
 		 609 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  30.27 
 
 		 991 aa  232  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  32.14 
 
 		 1474 aa  232  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  30.88 
 
 		 3235 aa  230  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3072  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 		 684 aa  229  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.839841  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3109  aspartate racemase  31.6 
 
 		 1981 aa  228  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  32.19 
 
 		 1276 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41238  predicted protein  30.42 
 
 		 738 aa  228  3e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  32.19 
 
 		 1291 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  32.19 
 
 		 1283 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  26.69 
 
 		 3235 aa  225  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 		 701 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  32.16 
 
 		 1323 aa  224  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 		 599 aa  224  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  33.21 
 
 		 610 aa  223  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1935  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.2 
 
 		 544 aa  223  9e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0140383  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  33.04 
 
 		 599 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  33.04 
 
 		 599 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3404  AMP-dependent synthetase and ligase  30.58 
 
 		 551 aa  222  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.469336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  33.04 
 
 		 610 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  33.57 
 
 		 599 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>