68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2692 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2692  AAA ATPase  100 
 
 		 469 aa  967    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2006  AAA+ class ATPase  53.03 
 
 		 468 aa  568  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1154  AAA ATPase  53.23 
 
 		 480 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2350  ATPase  45.24 
 
 		 478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.368284  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2121  AAA ATPase  44.31 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1748  AAA ATPase  43.23 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386005  normal  0.990458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1877  ATPase central domain-containing protein  41.49 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3240  ATPase central domain-containing protein  42.19 
 
 		 459 aa  385  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2981  AAA ATPase central domain protein  44.09 
 
 		 456 aa  383  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.169475  hitchhiker  0.00563801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2506  AAA ATPase  41.38 
 
 		 453 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.016721  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1859  AAA ATPase  40.41 
 
 		 519 aa  357  1.9999999999999998e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4235  AAA ATPase  37.55 
 
 		 536 aa  357  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2547  ATPase  40.86 
 
 		 441 aa  355  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0262176  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3352  AAA ATPase  40.96 
 
 		 578 aa  340  4e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1575  AAA ATPase  40.24 
 
 		 538 aa  333  5e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2674  AAA ATPase  40.73 
 
 		 538 aa  331  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2742  AAA ATPase  40 
 
 		 538 aa  330  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2642  ATPase  38.88 
 
 		 472 aa  326  7e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0791  ATPase  38.58 
 
 		 452 aa  322  6e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422248  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1120  hypothetical protein  37.71 
 
 		 435 aa  321  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1899  ATPase  37.38 
 
 		 436 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.525661  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0548  ATPase  37.38 
 
 		 436 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7203  ATPase  37.41 
 
 		 466 aa  317  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539522  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0988  hypothetical protein  37.35 
 
 		 441 aa  316  7e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2355  hypothetical protein  36.84 
 
 		 435 aa  315  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.896698  normal  0.762473 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6374  ATPase  37.9 
 
 		 466 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.858113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0296  ATPase with chaperone activity-like protein  37.14 
 
 		 436 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6786  ATPase  37.12 
 
 		 466 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162122 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5500  ATPase  37.12 
 
 		 466 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0649  ATPase  38.29 
 
 		 470 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.959728  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6290  AAA ATPase  35.45 
 
 		 466 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00474888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0593  ATPase with chaperone activity  37.85 
 
 		 499 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal  0.0676959 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5994  AAA ATPase  35.21 
 
 		 466 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4393  hypothetical protein  36.32 
 
 		 434 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3083  hypothetical protein  33.73 
 
 		 460 aa  299  9e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1310  hypothetical protein  33.73 
 
 		 460 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2958  hypothetical protein  33.73 
 
 		 460 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399029  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2266  ATPase with chaperone activity, putative  34.43 
 
 		 460 aa  297  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1628  ATPase with chaperone activity  37.19 
 
 		 427 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2011  AAA ATPase  35.84 
 
 		 440 aa  289  7e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302676  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2373  hypothetical protein  35.59 
 
 		 438 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.836855 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002642  predicted ATPase with chaperone activity associated with Flp pilus assembly  31.59 
 
 		 437 aa  233  6e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  48.48 
 
 		 566 aa  60.5  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  45.76 
 
 		 575 aa  52  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  38.96 
 
 		 637 aa  50.4  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  34.78 
 
 		 561 aa  48.5  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  37.5 
 
 		 571 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  39.19 
 
 		 558 aa  47  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.32 
 
 		 571 aa  47  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3928  General secretory system II protein E domain protein  39.66 
 
 		 345 aa  47  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00083498  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40 
 
 		 568 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0162  General secretory system II protein E domain protein  43.14 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.049981 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  21.92 
 
 		 324 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0180  General secretory system II protein E domain protein  43.14 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.57 
 
 		 568 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  38.57 
 
 		 568 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.57 
 
 		 568 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  41.38 
 
 		 1141 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  36.84 
 
 		 574 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4012  General secretory system II protein E domain protein  37.93 
 
 		 345 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.66345e-31 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0111  general secretory system II, protein E-like  35.82 
 
 		 370 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1037  general secretion pathway protein E  32.35 
 
 		 385 aa  44.3  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3480  General secretory system II protein E domain protein  35.44 
 
 		 181 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3416  General secretory system II protein E domain protein  35.44 
 
 		 181 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30476  predicted protein  42.31 
 
 		 737 aa  43.5  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.59852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02211  ABC transporter, ATP binding component  37.29 
 
 		 531 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.393006  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3335  general secretory system II, protein E-like  50 
 
 		 182 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0137168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.8 
 
 		 568 aa  43.1  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>