26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2667 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2667  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  157  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000715899  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1509  hypothetical protein  70.13 
 
 		 79 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3929  hypothetical protein  60.26 
 
 		 80 aa  102  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000115703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4013  hypothetical protein  60.26 
 
 		 80 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3140  hypothetical protein  63.77 
 
 		 80 aa  95.5  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000379803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4246  hypothetical protein  64.94 
 
 		 93 aa  90.5  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000585685  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0336  hypothetical protein  64.86 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00273364  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3357  hypothetical protein  58.97 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000003044  hitchhiker  0.0072657 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0013  hypothetical protein  50.67 
 
 		 82 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501969  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2089  ATP synthase protein I  41.98 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0218096  normal  0.87278 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0628  hypothetical protein  43.59 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380142  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1607  hypothetical protein  40.26 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2797  ATP synthase protein I  42.03 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0200156  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1386  ATP synthase protein I  35.14 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2698  ATP synthase protein I  42.62 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2064  ATP synthase protein I  37.14 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1583  ATP synthase protein I  34.43 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0022057  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4482  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2252  hypothetical protein  39.66 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00019318  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3673  hypothetical protein  42.86 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000387976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1894  putative ATP synthase  47.73 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0232779 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3247  hypothetical protein  43.64 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4474  hypothetical protein  37.5 
 
 		 83 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0553  ATP synthase protein, subunit I  41.86 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2595  ATP synthase F0, subunit I  38.89 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463887 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0511  ATP synthase protein, subunit I  40 
 
 		 110 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>