More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2633 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  100 
 
 
424 aa  853    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  50.48 
 
 
420 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  49.14 
 
 
435 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  46.21 
 
 
423 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  48.7 
 
 
421 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  47.28 
 
 
421 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  47.79 
 
 
426 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  27.78 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  29.87 
 
 
431 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  26.65 
 
 
419 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  27.07 
 
 
441 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  29.07 
 
 
431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  29.74 
 
 
419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  27.74 
 
 
419 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  28.1 
 
 
441 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  25.42 
 
 
443 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  24.3 
 
 
419 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  30.82 
 
 
453 aa  109  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  26.29 
 
 
446 aa  108  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  26.92 
 
 
441 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  29.29 
 
 
424 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  26.91 
 
 
453 aa  104  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  28.95 
 
 
491 aa  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 
427 aa  102  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  21.9 
 
 
425 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  24.25 
 
 
470 aa  100  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  24.66 
 
 
435 aa  94  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  27.4 
 
 
470 aa  92.4  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  25.16 
 
 
473 aa  91.3  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  25.16 
 
 
473 aa  91.3  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0041  outer membrane protein, putative  24.11 
 
 
457 aa  90.9  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.229451  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  25.85 
 
 
442 aa  90.1  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  27.93 
 
 
417 aa  89  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  26 
 
 
471 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.77 
 
 
452 aa  88.6  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  25.39 
 
 
439 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  27.83 
 
 
463 aa  87  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  27.03 
 
 
433 aa  87.4  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  26.37 
 
 
472 aa  87  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  22.82 
 
 
447 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  22.77 
 
 
447 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  22.61 
 
 
488 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  25.78 
 
 
461 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0785  Outer membrane efflux protein  21.56 
 
 
453 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0814  outer membrane efflux protein, putative  24.17 
 
 
452 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  23.01 
 
 
515 aa  80.9  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  25.25 
 
 
470 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.58 
 
 
456 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  28.11 
 
 
445 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  26.9 
 
 
463 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  20.79 
 
 
448 aa  80.1  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1456  outer membrane efflux protein  26.84 
 
 
446 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  23.73 
 
 
441 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  24.47 
 
 
438 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  24.11 
 
 
476 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  27.86 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.29 
 
 
522 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1525  outer membrane efflux protein  27.63 
 
 
442 aa  77  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000580745  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0977  outer membrane efflux protein  24.36 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000084232  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  23.37 
 
 
444 aa  77  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.53 
 
 
464 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  23.67 
 
 
436 aa  76.3  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  21.6 
 
 
458 aa  76.3  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  26.27 
 
 
482 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3124  outer membrane efflux protein  25.85 
 
 
448 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  27.33 
 
 
449 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  25.34 
 
 
462 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.54 
 
 
463 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  24.24 
 
 
461 aa  73.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  23.02 
 
 
436 aa  73.9  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4412  outer membrane efflux protein  23.09 
 
 
444 aa  73.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615231  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  27.25 
 
 
576 aa  73.6  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  22.51 
 
 
498 aa  73.6  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  22.53 
 
 
429 aa  73.2  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  24.82 
 
 
472 aa  73.2  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.88 
 
 
463 aa  73.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  27.67 
 
 
437 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.56 
 
 
479 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.56 
 
 
479 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.56 
 
 
471 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.56 
 
 
482 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.56 
 
 
482 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.56 
 
 
482 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.32 
 
 
487 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  22.68 
 
 
463 aa  71.2  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  29.17 
 
 
442 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.83 
 
 
489 aa  70.9  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  25 
 
 
479 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.28 
 
 
471 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.59 
 
 
467 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1042  outer membrane efflux protein  24.47 
 
 
453 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  26.22 
 
 
443 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.18 
 
 
488 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.36 
 
 
456 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.18 
 
 
497 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  24.28 
 
 
635 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.82 
 
 
457 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  23.53 
 
 
503 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3468  outer membrane efflux protein  25 
 
 
448 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000163735  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  23.67 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>