More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2632 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
161 aa  336  7e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  58.27 
 
 
140 aa  175  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  54.01 
 
 
149 aa  153  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 
137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  49.29 
 
 
142 aa  138  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  49.29 
 
 
142 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  39.49 
 
 
159 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
138 aa  87.8  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  35.38 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  40.43 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  40.43 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  51.43 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  38.54 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  29.93 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
184 aa  72  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
148 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  32.67 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1287  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
201 aa  67.8  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
205 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  30.83 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  33.63 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  34.13 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  38.46 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  28.48 
 
 
168 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  31.54 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  40.37 
 
 
147 aa  63.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  34.4 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  38.95 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
158 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
183 aa  62.4  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
175 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  27.46 
 
 
178 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  33.64 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  33.64 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>