More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2613 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  61.46 
 
 		 592 aa  729    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  62.38 
 
 		 616 aa  746    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  60.13 
 
 		 603 aa  747    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  59.58 
 
 		 621 aa  691    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  62.91 
 
 		 602 aa  748    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  100 
 
 		 625 aa  1262    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  59.8 
 
 		 602 aa  745    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  44.48 
 
 		 594 aa  528  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  44.52 
 
 		 622 aa  511  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  44.41 
 
 		 600 aa  496  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  44.39 
 
 		 642 aa  489  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  41.97 
 
 		 611 aa  487  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  44.07 
 
 		 592 aa  488  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  40.59 
 
 		 600 aa  482  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  41.54 
 
 		 611 aa  476  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  41.81 
 
 		 603 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  38.98 
 
 		 591 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  42.49 
 
 		 611 aa  467  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  40.13 
 
 		 608 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  39.67 
 
 		 586 aa  462  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  39.9 
 
 		 614 aa  464  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  40.33 
 
 		 619 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  42.74 
 
 		 610 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  39.64 
 
 		 613 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  39.4 
 
 		 635 aa  452  1e-125  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0039  putative ATP-binding component of a transport system  43.14 
 
 		 588 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0738965  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  39.77 
 
 		 588 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  39.47 
 
 		 590 aa  443  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  39.11 
 
 		 607 aa  444  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  40.75 
 
 		 617 aa  437  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  37.1 
 
 		 589 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  37.73 
 
 		 588 aa  430  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  37.09 
 
 		 587 aa  423  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  41.46 
 
 		 650 aa  417  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  37.42 
 
 		 597 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  36.42 
 
 		 587 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  36.8 
 
 		 584 aa  406  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1467  ABC transporter related  39.4 
 
 		 603 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000245046  normal  0.820859 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  41.07 
 
 		 614 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  39.31 
 
 		 608 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  38.37 
 
 		 610 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  38.21 
 
 		 610 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  37.04 
 
 		 587 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  37.04 
 
 		 587 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  37.04 
 
 		 587 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  37.27 
 
 		 588 aa  400  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.04 
 
 		 587 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.04 
 
 		 587 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  36.26 
 
 		 587 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  41.11 
 
 		 608 aa  395  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.87 
 
 		 587 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4342  ABC transporter, transmembrane region  38.82 
 
 		 626 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  37.25 
 
 		 587 aa  399  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  37.58 
 
 		 587 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  35.37 
 
 		 610 aa  398  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  36.54 
 
 		 609 aa  399  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  35.34 
 
 		 586 aa  396  1e-109  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  37.98 
 
 		 609 aa  395  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.87 
 
 		 587 aa  395  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  37.79 
 
 		 602 aa  395  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  39.73 
 
 		 622 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  37.37 
 
 		 585 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  37.93 
 
 		 637 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.82 
 
 		 589 aa  389  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  36.42 
 
 		 592 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  38.15 
 
 		 592 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  36.3 
 
 		 594 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  34.72 
 
 		 578 aa  382  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  35.82 
 
 		 599 aa  383  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  35.63 
 
 		 598 aa  385  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  37.56 
 
 		 632 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  37.88 
 
 		 632 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  39.2 
 
 		 598 aa  380  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  36.12 
 
 		 597 aa  381  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  34.7 
 
 		 594 aa  379  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  36.33 
 
 		 623 aa  377  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  37.16 
 
 		 607 aa  379  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3035  ABC transporter-like protein protein  36.81 
 
 		 626 aa  373  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1891  multidrug ABC transporter  36.26 
 
 		 598 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3126  ABC transporter related  43.39 
 
 		 592 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06251  putative multidrug efflux ABC transporter  36.09 
 
 		 598 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.761119  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  36.13 
 
 		 592 aa  366  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  37.69 
 
 		 600 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06161  putative multidrug efflux ABC transporter  36.47 
 
 		 598 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.898813  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  34.46 
 
 		 617 aa  365  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  38.59 
 
 		 606 aa  364  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  37.59 
 
 		 620 aa  365  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05641  putative multidrug efflux ABC transporter  37.75 
 
 		 599 aa  365  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  37.23 
 
 		 594 aa  364  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3227  ABC transporter-related protein  37.88 
 
 		 675 aa  363  4e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0834  ABC transporter related  40.26 
 
 		 677 aa  362  9e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.34775  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.24 
 
 		 618 aa  362  1e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  34.19 
 
 		 618 aa  361  2e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  34.18 
 
 		 597 aa  360  4e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  34.18 
 
 		 597 aa  360  5e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  34.9 
 
 		 576 aa  360  6e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  33.9 
 
 		 593 aa  359  6e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.44 
 
 		 578 aa  359  8e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0759  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  35.89 
 
 		 666 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4431  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.26 
 
 		 666 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0490625  normal  0.190774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>