More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2590 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_5004  chemotaxis sensory transducer  54.42 
 
 
672 aa  743    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.71371 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
675 aa  1381    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182127  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.25 
 
 
669 aa  444  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0982  domain of unknown function DUF1745  38.98 
 
 
666 aa  409  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.505903  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0690  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 
1186 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2083  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.68 
 
 
647 aa  300  8e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0223967  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1866  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.57 
 
 
650 aa  259  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1227  methyl-accepting chemotaxis protein  29.53 
 
 
553 aa  120  7e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0395  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine synthetase)  33.78 
 
 
663 aa  120  7.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  34.63 
 
 
655 aa  115  4.0000000000000004e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  34.63 
 
 
655 aa  115  4.0000000000000004e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  32.31 
 
 
653 aa  114  7.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1471  DNA processing chain A  34.07 
 
 
651 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1858  methyl-accepting chemotaxis protein  38.12 
 
 
700 aa  111  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  27.27 
 
 
447 aa  112  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.47 
 
 
663 aa  112  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0375988  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1679  methyl-accepting chemotaxis protein  38.12 
 
 
700 aa  111  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1498  methyl-accepting chemotaxis protein  38.12 
 
 
700 aa  111  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.756421  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1957  methyl-accepting chemotaxis protein  34.82 
 
 
654 aa  110  8.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1499  MCP-domain signal transduction protein  33.89 
 
 
694 aa  110  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1305  methyl-accepting chemotaxis protein  35.59 
 
 
652 aa  109  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.049405  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  35.59 
 
 
657 aa  108  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1394  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase (ptps; ptp synthase)  37.88 
 
 
656 aa  108  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.19 
 
 
588 aa  108  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.415929  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1645  methyl-accepting chemotaxis protein  35.59 
 
 
545 aa  108  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0567442  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  34.74 
 
 
654 aa  107  6e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1307  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 
596 aa  107  7e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917497  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  39.22 
 
 
633 aa  107  9e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1720  methyl-accepting chemotaxis protein  33.04 
 
 
664 aa  107  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  34.55 
 
 
544 aa  106  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000579859  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3929  methyl-accepting chemotaxis protein  37.78 
 
 
505 aa  105  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0314  methyl-accepting chemotaxis protein  32.88 
 
 
659 aa  105  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0180  methyl-accepting chemotaxis protein  32.88 
 
 
659 aa  105  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0312  methyl-accepting chemotaxis protein  32.88 
 
 
662 aa  105  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  32.86 
 
 
649 aa  105  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1735  methyl-accepting chemotaxis protein  32.88 
 
 
651 aa  104  5e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0458  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.95 
 
 
726 aa  104  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.386076  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1693  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.95 
 
 
598 aa  104  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0850375  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0377  Nitrate and nitrite sensing domain protein  33.47 
 
 
661 aa  104  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000413313  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  32.88 
 
 
665 aa  104  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2196  methyl-accepting chemotaxis protein  31.63 
 
 
604 aa  104  6e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0140  methyl-accepting chemotaxis protein  32.88 
 
 
540 aa  103  8e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0296  hypothetical protein  33.99 
 
 
160 aa  103  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.38 
 
 
528 aa  103  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0675  methyl-accepting chemotaxis protein  39.76 
 
 
542 aa  103  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0486909  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1915  methyl-accepting chemotaxis protein  33.03 
 
 
653 aa  103  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.633585  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  28.92 
 
 
400 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0837  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.83 
 
 
680 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0272085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 
544 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.21 
 
 
544 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1961  putative DNA-binding response regulator  39.05 
 
 
421 aa  102  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.18 
 
 
664 aa  102  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00177625  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  24.39 
 
 
460 aa  102  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.18 
 
 
664 aa  102  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.19 
 
 
537 aa  101  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000389108  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.66 
 
 
544 aa  101  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.66 
 
 
544 aa  101  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.07 
 
 
452 aa  101  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00060467  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4181  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.06 
 
 
498 aa  101  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1041  methyl-accepting chemotaxis protein  37.89 
 
 
731 aa  100  6e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.32701  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3114  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.21 
 
 
667 aa  100  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.59 
 
 
748 aa  100  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.65 
 
 
541 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.33 
 
 
602 aa  100  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.43 
 
 
652 aa  100  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3406  PAS  33.07 
 
 
521 aa  100  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387271  normal  0.671486 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1066  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.52 
 
 
705 aa  100  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2014  aerotaxis receptor  34 
 
 
521 aa  100  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  27.35 
 
 
464 aa  100  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  27.1 
 
 
392 aa  100  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.55 
 
 
372 aa  100  9e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.409493  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1202  chemotaxis sensory transducer  38.57 
 
 
380 aa  99.8  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0498  methyl-accepting chemotaxis protein  44.8 
 
 
365 aa  99.8  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.654005  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.59 
 
 
670 aa  99.8  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.474098  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1607  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.59 
 
 
668 aa  99.8  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.02 
 
 
505 aa  100  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.75 
 
 
667 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.97 
 
 
772 aa  100  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.22 
 
 
499 aa  100  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0811848  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1730  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  42.86 
 
 
707 aa  99.8  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000446671  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  29.11 
 
 
381 aa  99.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.75 
 
 
667 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.413203  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1234  methyl-accepting chemotaxis protein  38.92 
 
 
418 aa  100  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4393  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.76 
 
 
415 aa  99.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.29 
 
 
492 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178377  decreased coverage  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1568  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.57 
 
 
667 aa  99.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0500  methyl-accepting chemotaxis protein  41.67 
 
 
543 aa  99.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3459  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.29 
 
 
492 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1912  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.29 
 
 
492 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.407863  hitchhiker  0.000000143908 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3134  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.75 
 
 
667 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0135223  normal  0.80442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.89 
 
 
830 aa  99.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.59 
 
 
667 aa  99.4  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.59 
 
 
666 aa  99.8  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000844427  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.75 
 
 
673 aa  99.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000001862  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2976  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.75 
 
 
667 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000241408  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 
708 aa  99.8  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0981  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.57 
 
 
635 aa  99.4  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.779847  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0473  methyl-accepting chemotaxis protein  44.8 
 
 
365 aa  99.4  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614165  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.76 
 
 
533 aa  99.4  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0228  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.59 
 
 
667 aa  99.8  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>