More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2495 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 
385 aa  766    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  60.32 
 
 
381 aa  462  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  61.17 
 
 
383 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  55.61 
 
 
380 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  56.35 
 
 
380 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  54.01 
 
 
380 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  54.28 
 
 
380 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  47.58 
 
 
380 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  48 
 
 
382 aa  372  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  47.12 
 
 
381 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  45.7 
 
 
382 aa  349  4e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  50.13 
 
 
385 aa  346  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  45.58 
 
 
381 aa  344  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  47.71 
 
 
400 aa  339  4e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  45.99 
 
 
381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  43.85 
 
 
379 aa  335  5.999999999999999e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  46.44 
 
 
383 aa  332  6e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  45.72 
 
 
388 aa  331  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  46.72 
 
 
381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  39.47 
 
 
386 aa  324  1e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  38.95 
 
 
386 aa  319  3.9999999999999996e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  43.16 
 
 
380 aa  316  5e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  43.77 
 
 
381 aa  311  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  44.09 
 
 
384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  41.96 
 
 
385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  40.53 
 
 
378 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  46.81 
 
 
383 aa  301  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  45.03 
 
 
392 aa  290  4e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  40.98 
 
 
380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  41.03 
 
 
380 aa  282  7.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  36.24 
 
 
381 aa  272  7e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  42.16 
 
 
413 aa  269  5.9999999999999995e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  43.17 
 
 
379 aa  263  3e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  38.64 
 
 
388 aa  259  4e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  40.48 
 
 
388 aa  257  3e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  38.27 
 
 
398 aa  255  8e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  35.87 
 
 
382 aa  253  3e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  37.2 
 
 
390 aa  248  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  39.48 
 
 
387 aa  242  7e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  38.52 
 
 
376 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  36.87 
 
 
392 aa  239  5e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  33.88 
 
 
378 aa  238  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  35.49 
 
 
386 aa  236  4e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  37.5 
 
 
393 aa  230  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  36.9 
 
 
383 aa  208  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  33.78 
 
 
376 aa  205  1e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  34.56 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  33.42 
 
 
393 aa  200  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  36.66 
 
 
880 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  38.03 
 
 
408 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.63 
 
 
412 aa  196  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  36.64 
 
 
414 aa  195  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  34.68 
 
 
879 aa  194  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.77 
 
 
885 aa  193  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  35.19 
 
 
896 aa  191  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.44 
 
 
412 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  32.91 
 
 
420 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.29 
 
 
428 aa  189  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  35.62 
 
 
878 aa  188  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.1 
 
 
412 aa  188  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  30.93 
 
 
425 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  35.88 
 
 
425 aa  186  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  34.11 
 
 
417 aa  186  8e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12890  cysteine desulfurase  32.98 
 
 
422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0072  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.41 
 
 
417 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  35.29 
 
 
394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  31.57 
 
 
419 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.53 
 
 
406 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.56 
 
 
420 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  30.1 
 
 
417 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19482  cysteine desulfurase for iron-sulfur cluster formation suf  34.1 
 
 
496 aa  179  9e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.76 
 
 
406 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  32.74 
 
 
423 aa  179  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  36 
 
 
416 aa  178  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  34.47 
 
 
403 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00821  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  30.15 
 
 
417 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  32.3 
 
 
434 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  30.81 
 
 
408 aa  176  8e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.05 
 
 
406 aa  176  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  33.68 
 
 
393 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.61 
 
 
435 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.65 
 
 
425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  31.46 
 
 
410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3970  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.85 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.615432  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.66 
 
 
644 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.77 
 
 
406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  32.13 
 
 
420 aa  173  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26810  cysteine desulfurase  31.92 
 
 
409 aa  173  5e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  34.78 
 
 
421 aa  173  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  32 
 
 
641 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.62 
 
 
406 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  33.33 
 
 
405 aa  172  6.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.41 
 
 
407 aa  172  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  33.07 
 
 
405 aa  172  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  33.51 
 
 
406 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4450  aminotransferase class V  32.99 
 
 
405 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  hitchhiker  0.000499767 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  34.55 
 
 
416 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.96 
 
 
408 aa  170  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01341  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  30.67 
 
 
416 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.284649  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.29 
 
 
416 aa  171  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>