More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2484 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  84.1 
 
 		 380 aa  667    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 		 373 aa  783    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  77.99 
 
 		 368 aa  620  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  77.99 
 
 		 368 aa  620  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  77.45 
 
 		 368 aa  617  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  77.38 
 
 		 368 aa  617  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  74.66 
 
 		 368 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.9 
 
 		 369 aa  560  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.92 
 
 		 372 aa  429  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.15 
 
 		 369 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.55 
 
 		 374 aa  418  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.19 
 
 		 370 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.82 
 
 		 375 aa  418  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.37 
 
 		 373 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.37 
 
 		 380 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.65 
 
 		 371 aa  408  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.82 
 
 		 380 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.37 
 
 		 370 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.27 
 
 		 379 aa  403  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.82 
 
 		 379 aa  398  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 373 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 		 373 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.49 
 
 		 357 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.63 
 
 		 372 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.82 
 
 		 379 aa  398  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.96 
 
 		 373 aa  398  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 		 370 aa  398  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.18 
 
 		 379 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 		 379 aa  394  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.36 
 
 		 379 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.36 
 
 		 379 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.36 
 
 		 379 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.36 
 
 		 379 aa  392  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 367 aa  392  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.09 
 
 		 379 aa  392  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.36 
 
 		 379 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.36 
 
 		 379 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.32 
 
 		 367 aa  392  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.36 
 
 		 379 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.91 
 
 		 379 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.59 
 
 		 382 aa  392  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.09 
 
 		 379 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.04 
 
 		 372 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.5 
 
 		 387 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.04 
 
 		 372 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.09 
 
 		 379 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 		 369 aa  389  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.96 
 
 		 372 aa  389  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.7 
 
 		 380 aa  385  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.42 
 
 		 370 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.42 
 
 		 394 aa  388  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 379 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.59 
 
 		 375 aa  382  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.58 
 
 		 380 aa  381  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 376 aa  384  1e-105  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  50.14 
 
 		 382 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.33 
 
 		 380 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.33 
 
 		 380 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.27 
 
 		 380 aa  382  1e-105  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.31 
 
 		 387 aa  378  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.31 
 
 		 375 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.31 
 
 		 375 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.31 
 
 		 375 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.18 
 
 		 381 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.84 
 
 		 394 aa  377  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 		 369 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2808  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.54 
 
 		 376 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.634866  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1333  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.31 
 
 		 370 aa  375  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.299331  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.76 
 
 		 387 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3407  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.33 
 
 		 370 aa  378  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38542  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 		 374 aa  378  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.04 
 
 		 378 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1789  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.07 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.320337  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.31 
 
 		 375 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.31 
 
 		 375 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.31 
 
 		 375 aa  377  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  49.31 
 
 		 375 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.31 
 
 		 375 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.31 
 
 		 375 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.48 
 
 		 381 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.07 
 
 		 388 aa  378  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.76 
 
 		 375 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0596  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.97 
 
 		 390 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2352  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.21 
 
 		 391 aa  371  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0444  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.76 
 
 		 375 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.03 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1506  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 		 385 aa  373  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.966603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0466  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.98 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.76 
 
 		 375 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2944  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.81 
 
 		 376 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.76 
 
 		 375 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1315  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.77 
 
 		 376 aa  372  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2456  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.49 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.359127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1215  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 		 385 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557932 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  49.58 
 
 		 371 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.21 
 
 		 381 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.76 
 
 		 375 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5071  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.68 
 
 		 399 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>