More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2478 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  50.47 
 
 
864 aa  852    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
884 aa  1774    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  57.43 
 
 
882 aa  975    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  49.6 
 
 
883 aa  840    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  52.89 
 
 
860 aa  915    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  57.21 
 
 
882 aa  971    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  33.71 
 
 
884 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  30.82 
 
 
883 aa  363  7.0000000000000005e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 
886 aa  354  5e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 
886 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 
934 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  24.14 
 
 
929 aa  195  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.09 
 
 
988 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 
878 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.03 
 
 
1056 aa  155  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 
931 aa  153  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.49 
 
 
1022 aa  151  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.85 
 
 
810 aa  151  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.86 
 
 
1056 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  24.82 
 
 
729 aa  144  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.87 
 
 
1676 aa  144  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.96 
 
 
786 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.48 
 
 
818 aa  140  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.25 
 
 
4079 aa  139  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.56 
 
 
927 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  23.59 
 
 
573 aa  135  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.13 
 
 
2240 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.06 
 
 
784 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.25 
 
 
572 aa  126  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 
722 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  24.3 
 
 
573 aa  120  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 
573 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 
873 aa  118  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  22.33 
 
 
1694 aa  117  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 
927 aa  115  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.2 
 
 
572 aa  115  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 
767 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  23.54 
 
 
568 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  22.46 
 
 
892 aa  112  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 
1069 aa  109  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  22.72 
 
 
632 aa  109  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 
923 aa  108  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 
392 aa  108  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 
944 aa  107  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 
3145 aa  105  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.84 
 
 
1154 aa  104  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  21.54 
 
 
3172 aa  104  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 
800 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  19.69 
 
 
1979 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.13 
 
 
632 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  22.62 
 
 
567 aa  102  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 
649 aa  101  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 
847 aa  100  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 
729 aa  99  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0528  TPR domain-containing protein  21.02 
 
 
917 aa  96.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 
620 aa  96.7  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.7 
 
 
887 aa  96.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  20.97 
 
 
918 aa  96.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 
594 aa  96.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 
505 aa  95.5  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.14 
 
 
1737 aa  95.1  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  22.85 
 
 
1421 aa  94.7  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  20.44 
 
 
3301 aa  94.4  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.15 
 
 
935 aa  93.6  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.19 
 
 
733 aa  94  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2838  tetratricopeptide TPR_2  21.66 
 
 
940 aa  94  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.48 
 
 
557 aa  93.6  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.01 
 
 
566 aa  93.6  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  22.45 
 
 
924 aa  91.3  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  22.28 
 
 
605 aa  90.5  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 
808 aa  90.1  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23.15 
 
 
827 aa  90.1  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  20.53 
 
 
1276 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.59 
 
 
689 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  20.2 
 
 
635 aa  88.6  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  21.38 
 
 
1138 aa  87.8  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.24 
 
 
758 aa  87.8  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 
566 aa  88.2  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 
594 aa  87.8  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  20.33 
 
 
750 aa  87.8  9e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03692  TPR domain protein  23.71 
 
 
924 aa  87.8  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  21.54 
 
 
562 aa  87.4  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 
465 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0423  TPR repeat-containing protein  21.28 
 
 
880 aa  86.3  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0262641 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  20.59 
 
 
543 aa  85.9  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.3 
 
 
599 aa  86.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  21.78 
 
 
952 aa  84.7  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  21.44 
 
 
1049 aa  84.7  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 
602 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  22.69 
 
 
764 aa  83.2  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  22.09 
 
 
1056 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.14 
 
 
839 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  20.92 
 
 
725 aa  82.4  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  23.45 
 
 
767 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 
900 aa  82.4  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 
614 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  20.9 
 
 
1067 aa  82  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  24.91 
 
 
626 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24 
 
 
1486 aa  81.3  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>