45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2286 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2286  RelA/SpoT domain-containing protein  100 
 
 		 221 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0856  hypothetical protein  57.99 
 
 		 272 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.877348  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1423  RelA/SpoT domain-containing protein  53.49 
 
 		 242 aa  245  4.9999999999999997e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320561  normal  0.653719 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1575  GTP pyrophosphokinase-like protein  34.64 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000121431  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1858  GTP pyrophosphokinase-like protein  34.64 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000143095  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0199  hypothetical protein  33.33 
 
 		 349 aa  92  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.3269600000000002e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0070  RelA/SpoT domain protein  30.81 
 
 		 570 aa  69.7  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2058  RelA/SpoT domain-containing protein  26.04 
 
 		 542 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.25764  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  27.12 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  25.82 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  27.07 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1399  RelA/SpoT domain protein  27.88 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000071471  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1455  RelA/SpoT domain-containing protein  26.74 
 
 		 359 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000111353  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2888  RelA/SpoT domain protein  26.67 
 
 		 362 aa  52.4  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.5584100000000003e-34 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  25.29 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  25.54 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  27.07 
 
 		 230 aa  48.5  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1885  RelA/SpoT domain protein  25.41 
 
 		 356 aa  47.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  25.97 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2062  RelA/SpoT domain-containing protein  25.41 
 
 		 356 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123268  normal  0.165983 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  26.19 
 
 		 362 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2070  RelA / SpoT domain protein  29.24 
 
 		 329 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000115922  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  24.6 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  24.32 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  26.99 
 
 		 230 aa  45.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  26.99 
 
 		 230 aa  45.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  25.41 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  23.78 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  23.78 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  23.78 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  23.78 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  23.78 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  23.78 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  23.78 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  23.78 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  23.78 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  26.29 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  24.5 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  25.97 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  25.68 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  26.09 
 
 		 274 aa  42.7  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  22.46 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  22.46 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  23.2 
 
 		 263 aa  41.6  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  23.2 
 
 		 263 aa  41.6  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>