More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2264 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 
181 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  73.38 
 
 
157 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  69.38 
 
 
166 aa  231  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  66.47 
 
 
171 aa  228  5e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  63.69 
 
 
176 aa  226  9e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  70.95 
 
 
166 aa  221  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0065  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  69.43 
 
 
179 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5296  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  57.43 
 
 
166 aa  185  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000172102  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0400  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  51.23 
 
 
168 aa  184  7e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000750433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  57.43 
 
 
166 aa  184  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  53.9 
 
 
168 aa  183  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0020  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  56.76 
 
 
166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  56.76 
 
 
166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  56.76 
 
 
166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125537  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.13 
 
 
160 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0024  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  56.76 
 
 
166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000145543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  56.76 
 
 
166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0018  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  56.76 
 
 
166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.736614  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  58.28 
 
 
165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.97 
 
 
164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0616301  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  57.93 
 
 
154 aa  182  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0019  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  56.08 
 
 
166 aa  181  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0510921  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  52.87 
 
 
161 aa  179  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  54.97 
 
 
159 aa  179  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  55.63 
 
 
151 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.29 
 
 
164 aa  177  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1819  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein, putative  51.97 
 
 
172 aa  177  8e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000174201  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.08 
 
 
156 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0581  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  56.08 
 
 
156 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.679154  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0327  putative deaminase  58.17 
 
 
159 aa  175  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.38 
 
 
156 aa  171  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50.32 
 
 
166 aa  169  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.63 
 
 
164 aa  169  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  51.35 
 
 
151 aa  169  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0014  tRNA-adenosine deaminase  49.34 
 
 
158 aa  168  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574394  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0325  tRNA-adenosine deaminase  56.12 
 
 
170 aa  167  5e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00296157  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.66 
 
 
162 aa  167  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3893  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.32 
 
 
161 aa  167  8e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.29 
 
 
175 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.29 
 
 
175 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  52.32 
 
 
177 aa  166  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.29 
 
 
174 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  52.6 
 
 
172 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  52.6 
 
 
172 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  51.95 
 
 
178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.95 
 
 
167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  51.95 
 
 
178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  51.95 
 
 
167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  51.95 
 
 
167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  51.95 
 
 
178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  51.95 
 
 
178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  51.95 
 
 
178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.63 
 
 
175 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  51.95 
 
 
172 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  51.28 
 
 
222 aa  164  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  51.95 
 
 
172 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  51.95 
 
 
172 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.75 
 
 
182 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.75 
 
 
182 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  51.3 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0274  tRNA-adenosine deaminase  53.02 
 
 
168 aa  162  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
164 aa  161  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.32 
 
 
177 aa  161  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0017  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.67 
 
 
151 aa  161  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.34 
 
 
169 aa  160  9e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  47.47 
 
 
169 aa  160  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.32 
 
 
178 aa  160  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  48.73 
 
 
183 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  49.65 
 
 
148 aa  159  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  52.74 
 
 
158 aa  159  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  49.65 
 
 
148 aa  159  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.35 
 
 
150 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  45.51 
 
 
160 aa  158  4e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  50.66 
 
 
165 aa  158  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  51.8 
 
 
182 aa  157  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  53.42 
 
 
155 aa  157  7e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2030  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.74 
 
 
146 aa  156  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000721347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.3 
 
 
148 aa  156  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1307  tRNA-adenosine deaminase  51.92 
 
 
222 aa  156  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52 
 
 
189 aa  157  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  50.66 
 
 
168 aa  156  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  47.68 
 
 
166 aa  155  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.51 
 
 
170 aa  155  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1236  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.61 
 
 
252 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.469544  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  51.95 
 
 
167 aa  156  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0232  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  50.34 
 
 
157 aa  155  3e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0819594  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3779  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.9 
 
 
154 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3638  tRNA-adenosine deaminase  52.9 
 
 
160 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  49.33 
 
 
158 aa  155  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  49.01 
 
 
223 aa  155  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3324  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.58 
 
 
176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  51.32 
 
 
190 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.496749  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0088  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.39 
 
 
167 aa  154  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0760  hypothetical protein  48.98 
 
 
155 aa  154  6e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3291  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  49.4 
 
 
194 aa  153  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3696  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.17 
 
 
183 aa  153  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0595885  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.96 
 
 
168 aa  153  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0518  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55 
 
 
158 aa  153  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  45.12 
 
 
200 aa  152  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>