44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2263 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2263  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  435  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000459083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2496  hypothetical protein  40.37 
 
 
188 aa  136  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000377569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3620  hypothetical protein  45.81 
 
 
184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.794068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1247  hypothetical protein  44.05 
 
 
188 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3294  hypothetical protein  41.25 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157417  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0953  hypothetical protein  42.14 
 
 
195 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.585982 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1763  hypothetical protein  43.92 
 
 
183 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.4783800000000001e-18  normal  0.040844 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1752  hypothetical protein  42.42 
 
 
173 aa  98.6  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000963449  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0766  hypothetical protein  35.27 
 
 
255 aa  96.7  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00180926  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  40.6 
 
 
288 aa  91.3  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3095  hypothetical protein  33.33 
 
 
214 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1442  hypothetical protein  29.24 
 
 
265 aa  86.3  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.658193  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1431  hypothetical protein  39.6 
 
 
145 aa  84.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0232  hypothetical protein  38.89 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.12225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3170  hypothetical protein  40.74 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1035  hypothetical protein  35.25 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1092  hypothetical protein  39.81 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1180  hypothetical protein  31.58 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0908  hypothetical protein  37.59 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000542792  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0384  hypothetical protein  30 
 
 
202 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1496  hypothetical protein  35.82 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0782  hypothetical protein  49.06 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.674637  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1040  hypothetical protein  34.43 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194155  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1038  hypothetical protein  33.86 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  32.76 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1359  hypothetical protein  34.96 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0526065  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1095  hypothetical protein  41.51 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152193  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0131  hypothetical protein  44.29 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1497  hypothetical protein  33.06 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.844823  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1978  hypothetical protein  34.25 
 
 
165 aa  62.4  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3444  hypothetical protein  25.81 
 
 
313 aa  59.7  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000353163  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2248  hypothetical protein  32.88 
 
 
165 aa  59.7  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000924261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4081  hypothetical protein  26.79 
 
 
273 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000218694  normal  0.0348171 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3436  hypothetical protein  30.7 
 
 
283 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0293  hypothetical protein  27.68 
 
 
328 aa  49.3  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000169852  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1053  hypothetical protein  35.56 
 
 
192 aa  48.9  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.308187 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0935  hypothetical protein  35.56 
 
 
192 aa  48.9  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.879201  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0109  hypothetical protein  28.93 
 
 
321 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2234  hypothetical protein  31.91 
 
 
316 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.143589  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1713  hypothetical protein  32.98 
 
 
319 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0219056  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1640  hypothetical protein  32.98 
 
 
319 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0140573  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2054  hypothetical protein  24.35 
 
 
329 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3394  hypothetical protein  30.63 
 
 
270 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4028  hypothetical protein  32.65 
 
 
316 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145897  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>