More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2215 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  77.95 
 
 		 196 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  77.95 
 
 		 196 aa  318  3e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  65.8 
 
 		 193 aa  276  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  55.96 
 
 		 193 aa  229  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  49.22 
 
 		 198 aa  209  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 212 aa  184  8e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  44.15 
 
 		 214 aa  175  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 212 aa  174  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  43.89 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 186 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  41.05 
 
 		 222 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  41.01 
 
 		 179 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  40.21 
 
 		 209 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  41.05 
 
 		 209 aa  148  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  39.04 
 
 		 192 aa  147  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  39.33 
 
 		 219 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 219 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 227 aa  141  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  47.22 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 191 aa  131  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  126  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  121  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 190 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 190 aa  116  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 194 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0378  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 200 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 198 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  33.7 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  34.43 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 194 aa  105  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 176 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  32.24 
 
 		 196 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 197 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 209 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 196 aa  101  9e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  33.15 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  32.75 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0262  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 206 aa  99.4  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0261  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 198 aa  98.2  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3760  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 198 aa  98.2  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4468  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 194 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 196 aa  96.3  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 193 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 206 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 		 194 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 199 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 199 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 199 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
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