91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2175 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2175  peptidase C39, bacteriocin processing  100 
 
 		 237 aa  485  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1155  peptidase C39, bacteriocin processing  65.84 
 
 		 203 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3210  C39 family peptidase  46.4 
 
 		 231 aa  218  8.999999999999998e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0445  putative signal peptide protein  53.36 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0321  peptidase C39 bacteriocin processing  52.56 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0336  peptidase C39 bacteriocin processing  52.56 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.752621 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5873  peptidase (C39-family, bacteriocin processing)  53.81 
 
 		 232 aa  205  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1020  peptidase C39 bacteriocin processing  50.48 
 
 		 235 aa  201  8e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5392  peptidase C39, bacteriocin processing  56.07 
 
 		 209 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0260975  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3462  peptidase C39, bacteriocin processing  46.41 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2316  peptidase C39, bacteriocin processing  45.31 
 
 		 223 aa  181  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.543976  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2584  peptidase C39, bacteriocin processing  45.6 
 
 		 251 aa  162  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0738  peptidase C39, bacteriocin processing  39.25 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.772162  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39250  putative double-glycine peptidase  38.57 
 
 		 226 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050482  normal  0.369017 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03496  hypothetical protein  42.93 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0933  C39 family peptidase  38.97 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212685  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2960  peptidase C39 bacteriocin processing  36.2 
 
 		 237 aa  148  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0402092  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1024  putative peptidase  37.74 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0531887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2446  peptidase C39 bacteriocin processing  40.12 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2595  peptidase C39, bacteriocin processing  34.38 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2926  peptidase C39 bacteriocin processing  37.97 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2834  peptidase C39, bacteriocin processing  37.43 
 
 		 226 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2765  peptidase C39 bacteriocin processing  33.63 
 
 		 226 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2855  hypothetical protein  36.9 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4127  peptidase C39 bacteriocin processing  37.95 
 
 		 235 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936066 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2967  peptidase C39, bacteriocin processing  39.77 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3089  peptidase C39 bacteriocin processing  37.76 
 
 		 238 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3435  peptidase C39 bacteriocin processing  37.76 
 
 		 238 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.254055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2536  peptidase C39, bacteriocin processing  43.54 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160882  hitchhiker  0.00642935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3545  hypothetical protein  40.54 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2091  peptidase C39 bacteriocin processing  40.38 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0732241 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41780  hypothetical protein  39.86 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2422  peptidase C39 bacteriocin processing  35.63 
 
 		 251 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1801  peptidase C39, bacteriocin processing  30.97 
 
 		 266 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0785  peptidase C39 bacteriocin processing  39.32 
 
 		 427 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.031231 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3887  peptidase C39, bacteriocin processing  32.37 
 
 		 244 aa  81.6  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000193962  decreased coverage  0.00447347 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3038  peptidase C39 bacteriocin processing  29.3 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.227483  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  27.61 
 
 		 906 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  27.61 
 
 		 906 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1371  peptidase family protein  28.75 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  27.59 
 
 		 1675 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  30.66 
 
 		 715 aa  59.7  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  25.48 
 
 		 1011 aa  58.9  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  30 
 
 		 714 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6118  ABC transporter related  29.1 
 
 		 731 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  25.82 
 
 		 1040 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0055  peptidase family protein  26.24 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  27.63 
 
 		 734 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl264  putative multidrug ABC transporter  28.46 
 
 		 608 aa  56.2  0.0000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.04334e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  26.42 
 
 		 1042 aa  55.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2503  ATPase  26.87 
 
 		 715 aa  55.5  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.479102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  28.05 
 
 		 1038 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  27.41 
 
 		 908 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0068  peptidase family protein  26.06 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  26.06 
 
 		 721 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  31.58 
 
 		 1013 aa  52.8  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  28.36 
 
 		 748 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  27.82 
 
 		 1038 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  26.6 
 
 		 727 aa  52.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.34 
 
 		 1018 aa  52  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  24.52 
 
 		 722 aa  52  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  27.82 
 
 		 1018 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.62 
 
 		 908 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  27.27 
 
 		 727 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.07 
 
 		 1018 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  26.32 
 
 		 725 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2150  peptidase C39, bacteriocin processing  31.34 
 
 		 186 aa  48.9  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  normal  0.0669823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  25.76 
 
 		 743 aa  48.5  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  27.94 
 
 		 732 aa  48.5  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  26.61 
 
 		 721 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  27.14 
 
 		 738 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  27.91 
 
 		 716 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  26.56 
 
 		 722 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.07 
 
 		 1019 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  27.01 
 
 		 719 aa  46.6  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  25.95 
 
 		 724 aa  46.2  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  27.66 
 
 		 696 aa  45.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  24.81 
 
 		 726 aa  45.1  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  31.09 
 
 		 728 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  25.58 
 
 		 1717 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  29.13 
 
 		 726 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  26.92 
 
 		 730 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  25.19 
 
 		 715 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15711  hypothetical protein  24.09 
 
 		 731 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  24.81 
 
 		 736 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  24.83 
 
 		 722 aa  43.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  27.06 
 
 		 725 aa  42.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2331  ABC transporter-related protein  23.53 
 
 		 724 aa  42  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0873  ATPase  23.53 
 
 		 724 aa  42  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3755  ABC transporter related  25 
 
 		 707 aa  42  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561947  normal  0.0200117 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  27.54 
 
 		 727 aa  41.6  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>