More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2139 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 333 aa  680    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  53.44 
 
 		 316 aa  344  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  53.02 
 
 		 304 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  52.17 
 
 		 326 aa  315  8e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  51.96 
 
 		 304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  50.87 
 
 		 318 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  50.5 
 
 		 321 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  37.74 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  38.66 
 
 		 309 aa  215  7e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  32.6 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  35.09 
 
 		 314 aa  199  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.93 
 
 		 514 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  29.94 
 
 		 316 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  30.48 
 
 		 316 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  29.94 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  29.75 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  29.94 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  29.3 
 
 		 316 aa  193  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  29.3 
 
 		 316 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  28.66 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  29.3 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  31.8 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  36.49 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  30.16 
 
 		 316 aa  186  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  29.57 
 
 		 323 aa  182  6e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  33.33 
 
 		 506 aa  179  4e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.31 
 
 		 349 aa  179  8e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  27.59 
 
 		 298 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  32.91 
 
 		 293 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  27.67 
 
 		 298 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  28.9 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  30.23 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  31.06 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34.92 
 
 		 320 aa  160  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  27.9 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  28.96 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  27.9 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  29.03 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  34.95 
 
 		 315 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  34.02 
 
 		 312 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  28.53 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  34.57 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  32.14 
 
 		 331 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  31.06 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  35.27 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  29.57 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  31.72 
 
 		 287 aa  149  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  33.69 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  32.38 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  35.21 
 
 		 309 aa  145  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  32.54 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  27.76 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  31.23 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  30.97 
 
 		 358 aa  142  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  28.01 
 
 		 331 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  34.03 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18230  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.33 
 
 		 365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  34.25 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  32.75 
 
 		 291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0438  periplasmic solute binding protein  26.54 
 
 		 336 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.801015  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  30.58 
 
 		 303 aa  139  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  31.51 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.3 
 
 		 515 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.3 
 
 		 515 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  31.53 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  28.62 
 
 		 307 aa  136  5e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  28.35 
 
 		 306 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  34.9 
 
 		 346 aa  135  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  31.9 
 
 		 282 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  32.65 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  35.6 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  31.1 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  32.19 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  29.79 
 
 		 353 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  32.73 
 
 		 292 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0275  periplasmic solute binding protein  32.23 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  33.73 
 
 		 309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  31.99 
 
 		 327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  29.12 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  31.58 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  29.09 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  33.9 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  28.37 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0722  AfeA  28.87 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.738909  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  28.42 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  31.56 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  31.54 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  28.97 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  32.53 
 
 		 307 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  27.98 
 
 		 365 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 354 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  31.17 
 
 		 292 aa  126  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  27.11 
 
 		 339 aa  126  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  31.7 
 
 		 307 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2168  periplasmic solute binding protein  35.97 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0250158  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1011  periplasmic solute binding protein  28.48 
 
 		 357 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.932798  normal  0.91735 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  24.37 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  33.92 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  29.69 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>