154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2106 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2106  methyltransferase type 12  100 
 
 
565 aa  1170    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2399  glycosyl transferase, group 1  37.29 
 
 
996 aa  288  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.969384  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.65 
 
 
1561 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  34.22 
 
 
1509 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  39.48 
 
 
1171 aa  179  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0120  Methyltransferase type 12  35.15 
 
 
619 aa  177  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561606  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0238  hypothetical protein  22.22 
 
 
565 aa  70.5  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1968  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.05 
 
 
698 aa  64.3  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  25.78 
 
 
387 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.875361  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1198  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  25.78 
 
 
387 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0546  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  25.78 
 
 
387 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  25.6 
 
 
252 aa  57.4  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  26.86 
 
 
268 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  26.86 
 
 
268 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  25.6 
 
 
256 aa  55.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3573  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.17 
 
 
377 aa  53.5  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.716424  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  28.57 
 
 
249 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
252 aa  51.6  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6936  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.57 
 
 
343 aa  50.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389274  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
199 aa  50.4  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1494  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.64 
 
 
422 aa  49.7  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 
268 aa  50.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  32.61 
 
 
269 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  28.04 
 
 
246 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  23.63 
 
 
358 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  29.82 
 
 
236 aa  50.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  28.19 
 
 
244 aa  50.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  27.12 
 
 
250 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.74 
 
 
238 aa  49.7  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.64 
 
 
236 aa  49.3  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2807  methyltransferase type 11  24.7 
 
 
341 aa  49.3  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.160359  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 
273 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.39 
 
 
239 aa  49.3  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  25.78 
 
 
259 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  31.52 
 
 
269 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1748  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.12 
 
 
396 aa  48.9  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.829611  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  27.81 
 
 
213 aa  48.5  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1711  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.59 
 
 
447 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0226099  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  32 
 
 
1085 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.87 
 
 
232 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2563  Methyltransferase type 12  30.36 
 
 
246 aa  48.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  28.4 
 
 
369 aa  47.8  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  27.88 
 
 
258 aa  48.1  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  22.86 
 
 
268 aa  47.8  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3753  methyltransferase type 12  27.1 
 
 
242 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  24.35 
 
 
233 aa  47.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2460  hypothetical protein  28.35 
 
 
281 aa  47.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.171848  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.41 
 
 
239 aa  47.4  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1202  hypothetical protein  21.05 
 
 
585 aa  47.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1951  Methyltransferase type 11  27.64 
 
 
357 aa  47  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.066154 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01774  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.24 
 
 
356 aa  47  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.441761  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1388  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.85 
 
 
407 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.420857  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1760  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.28 
 
 
423 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.157791  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  30 
 
 
248 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1840  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.87 
 
 
345 aa  47  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670431 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  23.19 
 
 
246 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  27.43 
 
 
315 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
264 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.55 
 
 
262 aa  46.6  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  25.51 
 
 
270 aa  46.6  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1309  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.45 
 
 
423 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  27.78 
 
 
280 aa  46.2  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  27.78 
 
 
280 aa  46.2  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2929  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.63 
 
 
419 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2318  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  27.97 
 
 
359 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.300919  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  22.81 
 
 
233 aa  46.2  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  25.23 
 
 
235 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  28.04 
 
 
238 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  24.57 
 
 
207 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  30.43 
 
 
269 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  30.43 
 
 
269 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.44 
 
 
238 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  30.43 
 
 
269 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0358  cyclopropane fatty acid synthase family protein  23.75 
 
 
406 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000119082  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1060  cyclopropane fatty acid synthase family protein  23.75 
 
 
406 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.44 
 
 
236 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  30.43 
 
 
269 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  30.43 
 
 
269 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4485  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.64 
 
 
341 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0493356  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2643  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.64 
 
 
413 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2254  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.5 
 
 
417 aa  46.2  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.249887  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 
226 aa  46.2  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0798  cyclopropane fatty acid synthase-like protein  24.55 
 
 
374 aa  45.8  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000275065  hitchhiker  2.13005e-17 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  28.35 
 
 
226 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  26.11 
 
 
248 aa  46.2  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0658  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.75 
 
 
406 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0338601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2493  cyclopropane fatty acid synthase family protein  23.75 
 
 
406 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000280606  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0900  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.75 
 
 
406 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0491432  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0903  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.75 
 
 
406 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00630694  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2544  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.63 
 
 
419 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.35 
 
 
232 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  25.47 
 
 
229 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4911  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.34 
 
 
270 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.168902 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.05 
 
 
253 aa  46.2  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  25 
 
 
222 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2136  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.64 
 
 
457 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000408941 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  22.9 
 
 
241 aa  45.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  26.04 
 
 
229 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4840  methyltransferase type 11  23.72 
 
 
341 aa  45.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531482  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  25 
 
 
258 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>