More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2091 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  100 
 
 
278 aa  566  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  48.15 
 
 
267 aa  228  9e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  48.7 
 
 
267 aa  223  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  47.27 
 
 
280 aa  223  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  43.96 
 
 
271 aa  222  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  45.76 
 
 
269 aa  202  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  44.12 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  37.69 
 
 
268 aa  152  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  34.39 
 
 
309 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3856  methyltransferase type 11  40.43 
 
 
264 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  36.84 
 
 
291 aa  136  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3874  Methyltransferase type 11  41.09 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  35.34 
 
 
290 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  33.09 
 
 
269 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  34.87 
 
 
292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  32.87 
 
 
309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  32.47 
 
 
269 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  34.48 
 
 
292 aa  119  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3790  Methyltransferase type 11  41.09 
 
 
262 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3733  methyltransferase type 11  41.82 
 
 
262 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387697  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  32.12 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  32.12 
 
 
295 aa  117  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  37.28 
 
 
291 aa  116  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  33.09 
 
 
262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  30.04 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  30.08 
 
 
284 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  33.21 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  32.33 
 
 
312 aa  109  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  32.41 
 
 
268 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  31.2 
 
 
558 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  32.97 
 
 
294 aa  106  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  31.23 
 
 
307 aa  105  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  32.96 
 
 
267 aa  105  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  32.21 
 
 
275 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  33.2 
 
 
274 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  32.81 
 
 
272 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  32.41 
 
 
272 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  30.29 
 
 
315 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  33.84 
 
 
306 aa  102  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  29.59 
 
 
281 aa  101  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  29.59 
 
 
281 aa  101  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  32.22 
 
 
274 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  33.46 
 
 
295 aa  101  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  28.16 
 
 
283 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  27.41 
 
 
269 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  27.41 
 
 
269 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  32.02 
 
 
276 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  26.01 
 
 
279 aa  99.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  33.46 
 
 
267 aa  99  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  27.72 
 
 
269 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  27.41 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  27.41 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  26.79 
 
 
285 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  27.41 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  27.41 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  27.41 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  26.97 
 
 
269 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  31.23 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1049  Methyltransferase type 11  33.7 
 
 
252 aa  95.1  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.027968  normal  0.205367 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  30.63 
 
 
268 aa  95.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  27 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  30.45 
 
 
272 aa  94  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  31.4 
 
 
300 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  29.78 
 
 
294 aa  93.6  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  30.98 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  33.07 
 
 
367 aa  90.5  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  31.03 
 
 
260 aa  90.5  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  29.82 
 
 
297 aa  90.1  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1440  biotin synthesis protein BioC  31.46 
 
 
248 aa  90.1  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00159982  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  27.43 
 
 
338 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  28.47 
 
 
319 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  29.35 
 
 
321 aa  89.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  28.03 
 
 
268 aa  89.4  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  35.33 
 
 
213 aa  89  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  29.52 
 
 
266 aa  88.6  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  32.31 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  26.47 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  31.64 
 
 
313 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  30.19 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  30.94 
 
 
253 aa  87  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  32.88 
 
 
216 aa  87  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  30.37 
 
 
304 aa  85.9  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  28.62 
 
 
321 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  30.57 
 
 
338 aa  85.5  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  28.26 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  28.26 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  28.26 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  31.15 
 
 
333 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0725  hypothetical protein  28.82 
 
 
264 aa  84  0.000000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  27.68 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  29.64 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.9 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  29.63 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04918  conserved hypothetical protein  30.05 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0365995  normal  0.289567 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  22.85 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  30.19 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  28.99 
 
 
251 aa  78.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>