More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2047 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  371  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  69.73 
 
 		 185 aa  275  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  68.65 
 
 		 185 aa  268  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  70.27 
 
 		 185 aa  267  8e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  67.57 
 
 		 185 aa  263  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  65.95 
 
 		 185 aa  251  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  64.86 
 
 		 185 aa  249  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  55.14 
 
 		 185 aa  216  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  55.49 
 
 		 184 aa  214  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 186 aa  205  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  51.65 
 
 		 186 aa  204  5e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  52.2 
 
 		 186 aa  201  5e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  197  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  197  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  197  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 186 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  53.76 
 
 		 184 aa  191  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 184 aa  191  7e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  51.69 
 
 		 183 aa  189  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1589  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 191 aa  188  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.609942  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  44.26 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 192 aa  181  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0285  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0116  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  47.98 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0232  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0745  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000436383  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3832  ribosome recycling factor  44.44 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 186 aa  177  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 186 aa  176  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  44.75 
 
 		 184 aa  176  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  49.43 
 
 		 174 aa  177  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2280  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 186 aa  176  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.704245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0259  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1508  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 184 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1963  ribosome recycling factor  44.81 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.566814  normal  0.0766357 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1383  ribosome recycling factor  45.25 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  normal  0.0434538 
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  43.17 
 
 		 192 aa  174  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  43.82 
 
 		 185 aa  174  6e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0361  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  174  7e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000245194  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  45 
 
 		 187 aa  174  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  43.82 
 
 		 185 aa  174  9e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  44.2 
 
 		 184 aa  174  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  44.2 
 
 		 184 aa  174  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0305  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 187 aa  174  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.422351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  174  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  43.33 
 
 		 187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3273  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  44.44 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  43.09 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  46.11 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0660  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  43.78 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3265  ribosome recycling factor  43.33 
 
 		 186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  45 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  43.33 
 
 		 182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2802  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 188 aa  171  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00257577  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0341  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0418227  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0687  ribosome recycling factor  45.6 
 
 		 187 aa  171  5.999999999999999e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000279104  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  47.98 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3446  ribosome recycling factor  41.85 
 
 		 187 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  0.455289 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  43.65 
 
 		 184 aa  170  9e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0261  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1537  ribosome recycling factor  41.85 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  43.89 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>