More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2034 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  255  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  65.57 
 
 
150 aa  168  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  68.33 
 
 
129 aa  168  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2732  protein of unknown function UPF0054  67.77 
 
 
128 aa  167  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2284  hypothetical protein  65.79 
 
 
114 aa  159  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.621192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0998  protein of unknown function UPF0054  70.49 
 
 
132 aa  155  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.422032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3262  protein of unknown function UPF0054  70.49 
 
 
132 aa  155  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1233  hypothetical protein  62.5 
 
 
150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0777  hypothetical protein  52.58 
 
 
97 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.756727  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  41.38 
 
 
147 aa  94.7  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  44.04 
 
 
161 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  44.35 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  43.64 
 
 
158 aa  90.9  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  43.64 
 
 
158 aa  90.9  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  44.63 
 
 
156 aa  90.9  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  41.44 
 
 
162 aa  89.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  44.64 
 
 
161 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  43.33 
 
 
301 aa  89  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  42.73 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  41.96 
 
 
168 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  44.44 
 
 
153 aa  86.3  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  46.85 
 
 
154 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  42.11 
 
 
159 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  44.07 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  38.89 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  43.22 
 
 
156 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  43.22 
 
 
156 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  45.38 
 
 
193 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  38.6 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  41.88 
 
 
154 aa  84.3  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  47.96 
 
 
157 aa  84.3  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  40.74 
 
 
144 aa  83.6  9e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  42.37 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2305  protein of unknown function UPF0054  40.32 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154863  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  42.37 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  42.37 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  42.37 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  42.37 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  42.37 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  42.37 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  40.35 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2165  hypothetical protein  44.44 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  40.62 
 
 
157 aa  82  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  39.69 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  40.31 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  43.93 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  43.96 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  40.54 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  43.7 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  41.18 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  41.44 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  37.82 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  39.45 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0068  protein of unknown function UPF0054  38.53 
 
 
202 aa  77.8  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  41.18 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  41.18 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  40.71 
 
 
159 aa  76.6  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  37.61 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  37.07 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  38.18 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  38.39 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  42 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  36.36 
 
 
258 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  38.18 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  40.66 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  36.36 
 
 
258 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  40.35 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  36.36 
 
 
258 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  43.82 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  40.4 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  36.59 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  42.2 
 
 
411 aa  74.7  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  39.05 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  38.53 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  35.83 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2234  protein of unknown function UPF0054  39.22 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.797787  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0233  protein of unknown function UPF0054  42.05 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468321  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  41.96 
 
 
190 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  38.53 
 
 
446 aa  73.9  0.0000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  38.39 
 
 
274 aa  73.6  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  40 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2435  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  37.27 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  34.86 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0223  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  37.27 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0887  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  37.27 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  37.27 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  41.12 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  36.36 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2355  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  37.27 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3702  hypothetical protein  37.61 
 
 
152 aa  72  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.918527  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  43.68 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  35.78 
 
 
237 aa  72  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  35.34 
 
 
159 aa  72  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  39.58 
 
 
195 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  36.97 
 
 
162 aa  72  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  38.61 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  32.31 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4066  hypothetical protein  34.86 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0508  hypothetical protein  36.45 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  38.78 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>