More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2016 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  100 
 
 		 290 aa  598  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  82.07 
 
 		 288 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  76.21 
 
 		 286 aa  462  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  77.43 
 
 		 285 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  77.78 
 
 		 286 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  75.69 
 
 		 284 aa  450  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  75.35 
 
 		 284 aa  448  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  59.59 
 
 		 280 aa  332  6e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  59.04 
 
 		 281 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  57.68 
 
 		 281 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  50 
 
 		 306 aa  309  4e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.85 
 
 		 277 aa  308  5e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.51 
 
 		 278 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.16 
 
 		 309 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.86 
 
 		 276 aa  305  7e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.24 
 
 		 283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.15 
 
 		 296 aa  301  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  59.18 
 
 		 281 aa  301  9e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.84 
 
 		 300 aa  299  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.62 
 
 		 293 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.16 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.16 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  53.19 
 
 		 291 aa  289  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.19 
 
 		 291 aa  289  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.66 
 
 		 284 aa  287  1e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  48.1 
 
 		 312 aa  276  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  48 
 
 		 298 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.83 
 
 		 309 aa  267  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.95 
 
 		 329 aa  266  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.33 
 
 		 291 aa  266  4e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.38 
 
 		 277 aa  256  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.86 
 
 		 344 aa  250  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4452  nitrogen-fixing NifU-like  38.01 
 
 		 338 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  36.73 
 
 		 331 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1487  NifU-like protein  33.64 
 
 		 323 aa  178  9e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0043  nitrogen fixation protein NifU  32.73 
 
 		 330 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1162  acetolactate synthase small subunit  32.12 
 
 		 330 aa  172  5e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1771  NifU family protein  32.43 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.630256  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0237  NifU family protein  33.13 
 
 		 323 aa  169  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0290  NifU family protein  33.13 
 
 		 323 aa  169  5e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0264  NifU family protein  33.13 
 
 		 323 aa  169  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1697  nitrogen fixation protein NifU  32.34 
 
 		 333 aa  165  5.9999999999999996e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0518954  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2153  nitrogen-fixing NifU domain protein  31.29 
 
 		 329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.24 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  35.14 
 
 		 333 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2007  nitrogen-fixing NifU-like-like  32 
 
 		 324 aa  155  7e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  56.52 
 
 		 145 aa  152  8e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2001  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.4 
 
 		 203 aa  149  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.488301 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0207  IscU protein  38.89 
 
 		 203 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.55 
 
 		 150 aa  146  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  55.46 
 
 		 149 aa  143  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2231  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.39 
 
 		 203 aa  142  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.89 
 
 		 153 aa  142  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  56.3 
 
 		 129 aa  142  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2362  NifU domain-containing protein  39.29 
 
 		 203 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.201706  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  54.24 
 
 		 127 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0236  IscU protein  39.8 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50.35 
 
 		 142 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  50.35 
 
 		 144 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0366  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.83 
 
 		 203 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.041625  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  48.57 
 
 		 144 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  53.78 
 
 		 143 aa  139  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  56.78 
 
 		 143 aa  138  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.89 
 
 		 154 aa  138  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2174  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.36 
 
 		 203 aa  138  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  55.08 
 
 		 137 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  55.93 
 
 		 173 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.78 
 
 		 138 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  55.08 
 
 		 123 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.61 
 
 		 207 aa  135  8e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  53.78 
 
 		 125 aa  135  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  53.78 
 
 		 124 aa  135  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0533  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.36 
 
 		 200 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  54.62 
 
 		 139 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.94 
 
 		 131 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.94 
 
 		 153 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  51.26 
 
 		 124 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  49.17 
 
 		 137 aa  128  9.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  49.15 
 
 		 129 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  49.58 
 
 		 122 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.54 
 
 		 124 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1913  NifU domain-containing protein  55.46 
 
 		 147 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1478  scaffold protein  51.94 
 
 		 128 aa  122  5e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.671651  hitchhiker  0.00720513 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  52.42 
 
 		 139 aa  122  8e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  45.76 
 
 		 146 aa  122  9e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  47.9 
 
 		 129 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2178  scaffold protein  48.44 
 
 		 132 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00857387  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  52.46 
 
 		 130 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  49.19 
 
 		 139 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  50.76 
 
 		 135 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1046  FeS cluster assembly scaffold IscU  50 
 
 		 128 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2374  FeS cluster assembly scaffold IscU  47.66 
 
 		 133 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3998  FeS cluster assembly scaffold IscU  50 
 
 		 132 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455021  hitchhiker  0.00958668 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1657  scaffold protein  50.39 
 
 		 128 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.269786  hitchhiker  0.00054209 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  53.78 
 
 		 129 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.28 
 
 		 134 aa  119  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  50 
 
 		 135 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  48.8 
 
 		 182 aa  118  9e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.61 
 
 		 128 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  51.61 
 
 		 128 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>