More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2007 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  100 
 
 		 322 aa  650    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  74.53 
 
 		 322 aa  503  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  72.98 
 
 		 322 aa  474  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  72.67 
 
 		 322 aa  474  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  71.12 
 
 		 322 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  70.5 
 
 		 322 aa  463  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  69.88 
 
 		 322 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  51.88 
 
 		 322 aa  338  7e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  49.53 
 
 		 323 aa  305  6e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  46.2 
 
 		 343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  44.38 
 
 		 322 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  46.67 
 
 		 321 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0658  polyprenyl synthetase  48.89 
 
 		 341 aa  282  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.586121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  44.55 
 
 		 345 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  47.94 
 
 		 322 aa  281  9e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  45.94 
 
 		 360 aa  280  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  44.94 
 
 		 331 aa  279  5e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  45 
 
 		 356 aa  278  7e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  45.77 
 
 		 322 aa  278  7e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  44.69 
 
 		 328 aa  278  8e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  46.01 
 
 		 323 aa  278  8e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  44.38 
 
 		 340 aa  278  9e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  45.48 
 
 		 335 aa  278  9e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  45.34 
 
 		 323 aa  277  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  44.62 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  43.75 
 
 		 322 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  43.75 
 
 		 322 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  45.83 
 
 		 323 aa  275  6e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  43.75 
 
 		 322 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  46.79 
 
 		 333 aa  275  7e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  45 
 
 		 322 aa  275  8e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  44.06 
 
 		 322 aa  275  9e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  44.48 
 
 		 336 aa  275  9e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  44.65 
 
 		 340 aa  275  9e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  45.02 
 
 		 323 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  44.44 
 
 		 323 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  44.3 
 
 		 370 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  44.34 
 
 		 351 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  44.3 
 
 		 370 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  44.3 
 
 		 370 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  44.3 
 
 		 370 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  44.3 
 
 		 370 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  44.34 
 
 		 340 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  44.16 
 
 		 336 aa  273  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  43.3 
 
 		 320 aa  273  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  43.35 
 
 		 348 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  44.94 
 
 		 322 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  44.95 
 
 		 339 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  43.67 
 
 		 323 aa  272  5.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  43.75 
 
 		 322 aa  272  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  45 
 
 		 322 aa  272  7e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  46.2 
 
 		 334 aa  271  9e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  49.28 
 
 		 327 aa  271  9e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  43.85 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  42.59 
 
 		 341 aa  271  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  43.85 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  46.2 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  44.48 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  43.67 
 
 		 323 aa  270  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  44.16 
 
 		 336 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  43.99 
 
 		 323 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  43.67 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  43.67 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  43.67 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  45.34 
 
 		 331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  43.67 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  43.67 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  45.34 
 
 		 331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  45.45 
 
 		 334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  43.85 
 
 		 336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  45.34 
 
 		 331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  43.67 
 
 		 323 aa  270  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  44.44 
 
 		 337 aa  269  4e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  43.95 
 
 		 323 aa  269  5e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  41.56 
 
 		 338 aa  268  7e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  42.99 
 
 		 326 aa  268  7e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  45.79 
 
 		 325 aa  268  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  43.75 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  43.44 
 
 		 326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  45.02 
 
 		 331 aa  265  7e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0458  polyprenyl synthetase  46.13 
 
 		 338 aa  265  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.480075 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  42.68 
 
 		 324 aa  265  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  43.44 
 
 		 322 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2749  polyprenyl synthetase  43.24 
 
 		 345 aa  264  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0535555  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  44.27 
 
 		 323 aa  263  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  43.3 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  44.84 
 
 		 323 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  45.19 
 
 		 323 aa  263  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  43.44 
 
 		 322 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  45.16 
 
 		 323 aa  263  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  45.45 
 
 		 322 aa  263  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  42.19 
 
 		 322 aa  263  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3653  octaprenyl-diphosphate synthase  46.62 
 
 		 323 aa  263  4e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  46.36 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4378  Polyprenyl synthetase  43.24 
 
 		 345 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2996  octaprenyl-diphosphate synthase  47.83 
 
 		 340 aa  262  6e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2653  polyprenyl synthetase  45.69 
 
 		 330 aa  262  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00415418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  43.27 
 
 		 332 aa  262  6.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3126  trans-hexaprenyltranstransferase  46.95 
 
 		 331 aa  261  8e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000273118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  45.88 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>