More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1999 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  559  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  50.17 
 
 		 294 aa  271  7e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  51.72 
 
 		 310 aa  268  7e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.72 
 
 		 291 aa  265  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.51 
 
 		 314 aa  251  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  45.3 
 
 		 299 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.07 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  53.79 
 
 		 314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.15 
 
 		 314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.61 
 
 		 309 aa  243  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.07 
 
 		 317 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  45.45 
 
 		 329 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.91 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  41.72 
 
 		 311 aa  211  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  40.56 
 
 		 345 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  42.21 
 
 		 310 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  42.31 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  41.84 
 
 		 313 aa  208  9e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  40.14 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  40.07 
 
 		 308 aa  206  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  41.87 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  41.87 
 
 		 341 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  38.06 
 
 		 309 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  37.54 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.3 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  42.65 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  44.6 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  37.89 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  39.58 
 
 		 312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  38.68 
 
 		 294 aa  192  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  40.61 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  41.18 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  39.02 
 
 		 312 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  39.02 
 
 		 312 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  39.02 
 
 		 312 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  39.02 
 
 		 312 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  39.02 
 
 		 312 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  39.02 
 
 		 312 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.46 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.73 
 
 		 305 aa  178  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.85 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.39 
 
 		 305 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  39.1 
 
 		 324 aa  175  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.13 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  35.66 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3902  hypothetical protein  38.75 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.773994  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.14 
 
 		 298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3406  hypothetical protein  37.92 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2741  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.81 
 
 		 289 aa  155  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3545  hypothetical protein  37.72 
 
 		 297 aa  155  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  34.6 
 
 		 297 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  36.07 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  36.91 
 
 		 300 aa  152  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.99 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  36.65 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  33.82 
 
 		 303 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  33.82 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  34.19 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  33.82 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  33.82 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  33.46 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  33.82 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  33.82 
 
 		 303 aa  145  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  33.82 
 
 		 303 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  33.82 
 
 		 303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1230  hypothetical protein  38.55 
 
 		 315 aa  145  9e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.112754 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  33.09 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.72 
 
 		 307 aa  142  6e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  29.47 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  33.45 
 
 		 319 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  27.99 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8133  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.59 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  33.8 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1426  hypothetical protein  35.31 
 
 		 302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3611  hypothetical protein  36.11 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0603638  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  28.08 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  27.74 
 
 		 309 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  31.12 
 
 		 305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1370  hypothetical protein  32.2 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  27.55 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  31.58 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  31.12 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2701  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.69 
 
 		 312 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.07 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3401  hypothetical protein  35.85 
 
 		 322 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0214667 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  32.37 
 
 		 309 aa  122  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  29.37 
 
 		 301 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1227  hypothetical protein  34.7 
 
 		 317 aa  119  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  33.57 
 
 		 341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.76 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  28.97 
 
 		 296 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  28.97 
 
 		 296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  30.5 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  30.28 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  29.21 
 
 		 310 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  29.21 
 
 		 310 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  29.21 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2576  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.32 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160731  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>