More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1986 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1986  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  762    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1164  ABC transporter, permease protein  76.68 
 
 		 387 aa  568  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2405  hypothetical protein  75.52 
 
 		 387 aa  568  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0262818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1459  hypothetical protein  73.45 
 
 		 388 aa  556  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.789839  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0988  protein of unknown function DUF214  69.33 
 
 		 388 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3263  protein of unknown function DUF214  69.33 
 
 		 388 aa  533  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  62.95 
 
 		 388 aa  486  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  59.33 
 
 		 388 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  60.62 
 
 		 388 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3709  hypothetical protein  60.36 
 
 		 388 aa  454  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392463  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3400  ABC efflux pump, inner membrane subunit  59.33 
 
 		 388 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.089365  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2805  hypothetical protein  59.33 
 
 		 388 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.275109  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0301  hypothetical protein  59.33 
 
 		 388 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157711  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0282  hypothetical protein  59.07 
 
 		 388 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.548142  hitchhiker  0.0000619818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0204  hypothetical protein  58.81 
 
 		 388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20132  unclonable  0.000000000008111 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0228  hypothetical protein  58.55 
 
 		 388 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000368299 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0220  hypothetical protein  58.29 
 
 		 388 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0628  protein of unknown function DUF214  63.24 
 
 		 391 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0398137 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0255  hypothetical protein  58.38 
 
 		 389 aa  425  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  39.1 
 
 		 394 aa  286  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1512  hypothetical protein  35.51 
 
 		 396 aa  222  7e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  35.79 
 
 		 396 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0817  hypothetical protein  33.87 
 
 		 393 aa  210  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0251  protein of unknown function DUF214  34.65 
 
 		 440 aa  203  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03340  ABC transporter permease  33.14 
 
 		 431 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2023  hypothetical protein  31.74 
 
 		 395 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2580  protein of unknown function DUF214  32.77 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2258  protein of unknown function DUF214  33.04 
 
 		 402 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3164  protein of unknown function DUF214  26.86 
 
 		 454 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  26.04 
 
 		 371 aa  93.2  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  27.15 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  24.68 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  24.05 
 
 		 415 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  27.23 
 
 		 414 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  29.69 
 
 		 488 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  25.36 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  27.14 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  27.8 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  26.14 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  27.56 
 
 		 842 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1359  permease, putative  30 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00178118  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  25.74 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  26.88 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  22.12 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  26.69 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  24.1 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  27.61 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  23.77 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1563  protein of unknown function DUF214  22.39 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  32.94 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  21.66 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  28.12 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  27.2 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  27.01 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  24.47 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  28.19 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  28.52 
 
 		 387 aa  67  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  24.09 
 
 		 389 aa  67  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3335  ABC transporter, permease protein  25.89 
 
 		 463 aa  67  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.887003  normal  0.0261397 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  28.64 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  25.18 
 
 		 389 aa  67  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  36.84 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  23.8 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  31.17 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  31.41 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  25.84 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  25.5 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  29.1 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  34.48 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  25.45 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  30.83 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  25.5 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  41.22 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.67 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  24.58 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  28.72 
 
 		 652 aa  63.2  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  30.94 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  26.82 
 
 		 411 aa  62.8  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  30.37 
 
 		 400 aa  62.8  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  33.33 
 
 		 650 aa  62.8  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  27.84 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  25.84 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  29.65 
 
 		 645 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  25.84 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  25.93 
 
 		 643 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  25.29 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  30.71 
 
 		 454 aa  62  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  24.9 
 
 		 642 aa  62  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  23.08 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  26.12 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  26.69 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  36.21 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  31.16 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  27.9 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2085  putative ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 		 475 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01072  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1112  efflux ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 		 475 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  26.67 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  27.47 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2376  efflux ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 		 475 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  29.59 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>