More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1982 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
101 aa  209  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  73.33 
 
 
91 aa  144  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  70 
 
 
91 aa  141  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  70 
 
 
94 aa  140  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  71.11 
 
 
100 aa  139  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  69.66 
 
 
92 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  68.89 
 
 
94 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1661  transcriptional regulator  60.22 
 
 
127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
91 aa  97.4  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  53.85 
 
 
98 aa  90.5  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  51.81 
 
 
98 aa  89.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
96 aa  81.6  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  52.11 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 
111 aa  74.7  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0069  transcriptional repressor PagR  45.98 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02390  regulatory protein ArsR  43.21 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3439  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
88 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3120  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
88 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127966  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2987  regulatory protein ArsR  41.38 
 
 
96 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4339  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
96 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0861  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 
96 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4000  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
100 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4010  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
100 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0148  ArsR family transcriptional regulator  45.78 
 
 
91 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4279  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 
96 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4373  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 
96 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4112  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
96 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  42.67 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  42.67 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4392  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 
96 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4161  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0906669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1816  transcriptional regulator, ArsR family  43.18 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98028  normal  0.175921 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3430  transcriptional regulator, ArsR family  43.18 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4483  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2592  regulatory protein ArsR  40.51 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.108396 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2393  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0242789  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5558  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249021 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0221  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000466476  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0200  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0013228  hitchhiker  4.7495300000000004e-23 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  45.57 
 
 
87 aa  67.4  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3227  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
91 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3201  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
91 aa  67  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00511684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3134  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
91 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.339641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3442  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 
91 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3479  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
91 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3457  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 
91 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2201  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00183018  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2140  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00329854  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2123  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000110914  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2382  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2363  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2328  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0244  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.10115e-49 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2996  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00129565  normal  0.033071 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2463  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000234537  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0166  transcriptional repressor PagR  45.45 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  36.78 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2171  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0439276  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5478  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.350529  hitchhiker  0.00151942 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  42.47 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  38.14 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  34 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0649  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4688  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000941473  hitchhiker  1.78464e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
95 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 
95 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  34.62 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  39.08 
 
 
98 aa  62.8  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  35.16 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0048  transcriptional regulator, ArsR family protein  37.35 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0663056  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  45.07 
 
 
135 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  40.22 
 
 
95 aa  62  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  41.25 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  46.38 
 
 
184 aa  62.8  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  45.07 
 
 
135 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 
109 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3065  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
99 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534243  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  31 
 
 
109 aa  61.6  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3305  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
99 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 
221 aa  61.6  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
98 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  32.05 
 
 
105 aa  60.8  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>