249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1934 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1934  bile acid:sodium symporter  100 
 
 
324 aa  638    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000370816  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1578  arsenite efflux pump ACR3 and related permeases  76.1 
 
 
323 aa  444  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2603  Bile acid:sodium symporter  61.73 
 
 
325 aa  368  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000713647  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  57.68 
 
 
515 aa  365  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0408  sodium/bile acid symporter family protein  60.06 
 
 
325 aa  349  3e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1411  sodium/bile acid symporter family protein  58.39 
 
 
331 aa  343  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.618786  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2303  Bile acid:sodium symporter  61.32 
 
 
334 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000645275  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1293  Bile acid:sodium symporter  56.21 
 
 
327 aa  332  5e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0627  bile acid:sodium symporter  56.21 
 
 
333 aa  317  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0125709 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0197  bile acid:sodium symporter  55.35 
 
 
362 aa  316  3e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0279028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03690  Bile acid:sodium symporter  37.46 
 
 
315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0554  bile acid:sodium symporter  30.57 
 
 
350 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000301487  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0693  Bile acid:sodium symporter  29.55 
 
 
338 aa  100  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0172  Bile acid:sodium symporter  28.72 
 
 
328 aa  100  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0310359  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2827  arsenical-resistance protein  30.16 
 
 
355 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1981  arsenical-resistance protein  29.94 
 
 
352 aa  88.6  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182111  normal  0.240849 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3198  arsenical-resistance protein  29.21 
 
 
362 aa  87  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0589  arsenical-resistance protein  26.28 
 
 
377 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3325  arsenical-resistance protein  26.77 
 
 
355 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1933  arsenical-resistance protein  24.04 
 
 
348 aa  82.4  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3208  arsenite efflux transporter ArsB  24.93 
 
 
346 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84963  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0159  arsenite efflux transporter ArsB  25.08 
 
 
351 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1603  arsenical-resistance protein  25.39 
 
 
351 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2137  arsenical-resistance protein  28.94 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2920  arsenical-resistance protein  24.64 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000814445  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  26.14 
 
 
354 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3134  arsenical-resistance protein  28.71 
 
 
357 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79933  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2899  arsenical-resistance protein  24.64 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  28.48 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2061  arsenical-resistance protein  24.35 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2972  arsenical-resistance protein  23.99 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000703133  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2964  arsenical-resistance protein  24.06 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3197  arsenical-resistance protein  23.99 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3222  arsenical-resistance protein  24.06 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3202  arsenical-resistance protein  24.35 
 
 
346 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0466  arsenical-resistance protein  24.19 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0132809  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5148  arsenical-resistance protein  27.97 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317121  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1478  arsenite efflux pump ACR3  25.33 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  25.91 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  25 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  25 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  25 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  24.83 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1578  arsenical-resistance protein  25.95 
 
 
348 aa  75.9  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0214  arsenical-resistance protein  24.68 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  25 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1212  arsenical-resistance protein  24.59 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  25 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0303  arsenical-resistance protein  24.3 
 
 
328 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  24.25 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1702  arsenical-resistance protein ACR3  24.35 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1873  arsenical-resistance protein  25.93 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5054  arsenical-resistance protein  28.12 
 
 
359 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3340  arsenical-resistance protein  27.24 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1119  arsenical-resistance protein  24.52 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.335014 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  24.63 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  24.63 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1516  arsenite efflux transporter  24.6 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2349  arsenical-resistance protein  23.97 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  23.66 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1555  arsenical-resistance protein ACR3  27.15 
 
 
362 aa  72.4  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.362934  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2021  arsenical-resistance protein  23.85 
 
 
351 aa  72  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0846  arsenical-resistance protein  25.14 
 
 
351 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1733  arsenical-resistance protein, putative  22.99 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.126518  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001409  arsenical-resistance protein ACR3  23.28 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3187  arsenical-resistance protein  23.55 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  30.11 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06339  arsenite transporter  23.78 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2954  arsenical-resistance protein  24.53 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0520  arsenical-resistance protein ACR3  23.97 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2570  arsenical-resistance protein  24 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5376  arsenical-resistance protein  26.17 
 
 
367 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14670  arsenical-resistance protein  23 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2859  arsenical-resistance protein  23.71 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0467  arsenical-resistance protein  23.34 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2958  arsenical-resistance protein  23.63 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.610234  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  25.39 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0756  arsenical-resistance protein  26.11 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.442454  hitchhiker  0.00390365 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0457  bile acid:sodium symporter  24.33 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1155  arsenical-resistance protein  25.44 
 
 
346 aa  67  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040708  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3430  arsenical-resistance protein  23.88 
 
 
369 aa  67  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383745  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3652  arsenical-resistance protein  23.24 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  25 
 
 
381 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2208  arsenical-resistance protein  24.47 
 
 
354 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142179  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2825  Bile acid:sodium symporter  25.22 
 
 
325 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0841  arsenical-resistance protein  23.51 
 
 
353 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.437226  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1444  arsenical-resistance protein  24.25 
 
 
357 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.953895  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2791  arsenical-resistance protein  23.55 
 
 
362 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1289  arsenical-resistance protein  23.96 
 
 
354 aa  64.7  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0606387  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1026  arsenite transporter-like permease, ACR3 family  22.56 
 
 
354 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000872281  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0368  arsenical-resistance protein  21.84 
 
 
378 aa  64.7  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  24.06 
 
 
389 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0389  arsenical-resistance protein  21.45 
 
 
368 aa  64.3  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3469  arsenical-resistance protein  23.65 
 
 
368 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4497  arsenical-resistance protein  22.14 
 
 
368 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3602  arsenical-resistance protein  24.45 
 
 
357 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.494637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1657  arsenical-resistance protein  23.95 
 
 
363 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0604367  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3146  arsenical-resistance protein  24.43 
 
 
354 aa  63.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.798277  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1085  arsenical-resistance protein  25.93 
 
 
381 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55277  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20620  arsenical-resistance protein  24.17 
 
 
350 aa  63.2  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>