More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1931 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1931  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
107 aa  220  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0246294  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
104 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  46.15 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1768  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 
112 aa  61.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  46.97 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  47.69 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3658  transcriptional regulator, ArsR family  46.97 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  46.15 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  39.19 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  41.27 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
106 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 
94 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  45.31 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
106 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
123 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
109 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
317 aa  55.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  36.11 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  37.88 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
135 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  41.79 
 
 
103 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  37.88 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
305 aa  53.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2627  ArsR family transcriptional regulator  45.31 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.8267  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5093  protein tyrosine phosphatase  37.8 
 
 
225 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2808  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.598578  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2282  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55835  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  40 
 
 
114 aa  52  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2556  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 
119 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
94 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
124 aa  52  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
124 aa  52  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
124 aa  52  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 
122 aa  52.8  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 
107 aa  51.6  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2713  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
102 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5389  transcriptional regulator, ArsR family  40.3 
 
 
111 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
99 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
101 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
107 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 
120 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  36.99 
 
 
105 aa  51.6  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  41.79 
 
 
164 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
227 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  37.31 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  37.88 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 
84 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0682  transcriptional regulator, ArsR family  34.07 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
119 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 
105 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
111 aa  50.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
125 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  44.62 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5228  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 
102 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395015 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
116 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
116 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 
118 aa  50.4  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
270 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  37.31 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
124 aa  50.1  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
116 aa  50.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
104 aa  50.1  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 
120 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2878  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  36.23 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  44.62 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  39.34 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  36.62 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  30.21 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  30.21 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0727  transcriptional regulator, ArsR family  43.08 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3099  regulatory protein ArsR  30.21 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>