More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1907 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 107 aa  215  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  48.57 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  43.33 
 
 		 245 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2402  XRE family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.314707  normal  0.620084 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  37.31 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2696  transcriptional regulator, XRE family  45.21 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2256  Cro/CI family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.033693 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  37.31 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3482  XRE family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.411907  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 1143 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0924  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  35.05 
 
 		 323 aa  52  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325541  normal  0.296459 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0386  transcriptional regulator, XRE family  34.09 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000617682 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  31 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0424  transcriptional regulator, XRE family  39.58 
 
 		 282 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  37.33 
 
 		 488 aa  51.2  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 432 aa  50.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 252 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5529  putative transcriptional regulator PlcR  33.65 
 
 		 285 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1388  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0734  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3349  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 433 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5705  transcriptional regulator, XRE family  31.31 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.712971 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 210 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  51.02 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0631  hypothetical protein  38.81 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 194 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3942  transcriptional regulator, XRE family  36.26 
 
 		 197 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3080  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.995144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4442  DNA-binding protein  40 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0971  transcriptional regulator, XRE family  31.63 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.508784  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4443  DNA-binding protein  40 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5481  transcriptional regulator PlcR, putative  35.42 
 
 		 285 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4258  DNA-binding protein  40 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0755  DNA-binding protein  40 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4094  transcriptional regulator  40 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 200 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4105  transcriptional regulator  40 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1041  helix-turn-helix domain-containing protein  31.63 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0368815 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4481  DNA-binding protein  40 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4590  DNA-binding protein  40 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1168  transcriptional regulator, XRE family  31.63 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.092853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  45 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5473  putative transcriptional regulator PlcR  34.38 
 
 		 285 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00043011  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4493  DNA-binding protein  40 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 208 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  43.86 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  43.86 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4302  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 79 aa  48.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.397769  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0039  PbsX family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  43.86 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5033  transcription activator  33.33 
 
 		 285 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.191322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5049  transcriptional activator  33.33 
 
 		 285 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  43.86 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  43.86 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2052  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.14736  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  45.76 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  43.86 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  32.14 
 
 		 436 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  40 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 321 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  27.55 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5443  putative transcriptional regulator PlcR  35.48 
 
 		 285 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3869  helix-turn-helix domain-containing protein  41.27 
 
 		 288 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00219461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5199  transcriptional regulator, PlcR  35.48 
 
 		 213 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0169  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0155  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 209 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5479  putative transcriptional regulator PlcR  34.38 
 
 		 285 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000111873  hitchhiker  1.75075e-16 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4415  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 213 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  43.86 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  42.86 
 
 		 200 aa  47.8  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3762  transcriptional regulator, XRE family  31.31 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0695  transcriptional regulator, XRE family  46.94 
 
 		 101 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 198 aa  47.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08540  predicted transcriptional regulator  37.1 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102347 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  44.9 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  36.25 
 
 		 476 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>