More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1901 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  100 
 
 
200 aa  403  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  55.45 
 
 
201 aa  225  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  53.96 
 
 
201 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  50.25 
 
 
203 aa  209  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  53.2 
 
 
201 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  50.25 
 
 
201 aa  201  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1572  SOS-response transcriptional repressor, LexA  48.6 
 
 
217 aa  201  7e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  49.26 
 
 
201 aa  199  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0192  SOS-response transcriptional repressor, LexA  48.51 
 
 
200 aa  188  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  48.51 
 
 
209 aa  187  9e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  46.34 
 
 
204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  45.41 
 
 
206 aa  179  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  45.41 
 
 
269 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  45.41 
 
 
206 aa  179  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  45.41 
 
 
269 aa  179  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  45.41 
 
 
223 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  45.41 
 
 
206 aa  179  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  45.93 
 
 
207 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  45.41 
 
 
206 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  45.41 
 
 
223 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  45.41 
 
 
223 aa  179  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  45.41 
 
 
206 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  44.66 
 
 
207 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  47.29 
 
 
202 aa  176  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  45.32 
 
 
222 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.39 
 
 
207 aa  166  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.72 
 
 
204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.91 
 
 
222 aa  165  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.78 
 
 
205 aa  164  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  43.65 
 
 
203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  43.65 
 
 
203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.13 
 
 
235 aa  162  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  41.71 
 
 
204 aa  162  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.52 
 
 
213 aa  160  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  40.67 
 
 
207 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  40.67 
 
 
207 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  42.79 
 
 
204 aa  159  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  39.9 
 
 
206 aa  157  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  42.58 
 
 
204 aa  155  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.64 
 
 
206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2446  transcriptional repressor, LexA family  41.35 
 
 
226 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1204  LexA repressor  41.67 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000092857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.3 
 
 
197 aa  152  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.93 
 
 
214 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.76 
 
 
215 aa  151  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.12 
 
 
212 aa  149  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  39.3 
 
 
197 aa  149  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  37.85 
 
 
217 aa  148  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  38.71 
 
 
238 aa  147  9e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  38.46 
 
 
261 aa  145  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2221  LexA repressor  38.05 
 
 
233 aa  143  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110096  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  37.09 
 
 
230 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  37.02 
 
 
258 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  37.09 
 
 
230 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.7 
 
 
196 aa  143  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  37.09 
 
 
230 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  37.67 
 
 
236 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2433  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.97 
 
 
219 aa  142  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342507  normal  0.324912 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  36.84 
 
 
275 aa  141  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  40.2 
 
 
210 aa  141  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  36.99 
 
 
230 aa  140  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3956  LexA repressor  36.62 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2441  LexA repressor  36.74 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628301  normal  0.115914 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.39 
 
 
229 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.55 
 
 
228 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  37.23 
 
 
230 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3510  LexA repressor  34.78 
 
 
256 aa  139  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  39.02 
 
 
207 aa  139  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1808  transcriptional repressor, LexA family  37.09 
 
 
236 aa  138  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17230  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.49 
 
 
233 aa  138  6e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.302677 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2152  peptidase S24, LexA repressor  38.21 
 
 
252 aa  137  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0120342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.05 
 
 
235 aa  137  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.5 
 
 
229 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0200  LexA repressor  37.25 
 
 
206 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3515  LexA repressor  36.82 
 
 
205 aa  137  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0770  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.7 
 
 
217 aa  137  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.953907  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1232  LexA repressor  36.61 
 
 
250 aa  136  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  0.0166325 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0970  XRE family transcriptional regulator  39.05 
 
 
212 aa  136  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10620  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.68 
 
 
234 aa  136  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.445804  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1566  transcriptional repressor, LexA family  35.11 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000959525 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0127  LexA repressor  36.95 
 
 
205 aa  135  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07330  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.36 
 
 
238 aa  135  5e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.140562  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.77 
 
 
231 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3524  LexA repressor  38.42 
 
 
203 aa  135  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  35.48 
 
 
263 aa  135  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.97 
 
 
212 aa  135  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.92 
 
 
206 aa  135  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3950  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.93 
 
 
202 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1300  LexA repressor  37.44 
 
 
202 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4505  LexA repressor  37.93 
 
 
202 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5524  LexA repressor  37.93 
 
 
202 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194949  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3770  LexA repressor  37.44 
 
 
202 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.638288  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1184  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.19 
 
 
199 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4554  LexA repressor  37.93 
 
 
202 aa  133  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3985  LexA repressor  37.93 
 
 
202 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.359891 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3860  LexA repressor  37.44 
 
 
202 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.528638  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4283  LexA repressor  37.93 
 
 
202 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4596  LexA repressor  37.93 
 
 
202 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2243  LexA repressor  43.5 
 
 
198 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03875  hypothetical protein  37.93 
 
 
202 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.453972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>