More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1867 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
186 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  58.1 
 
 
187 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  58.1 
 
 
187 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  57.54 
 
 
187 aa  229  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  57.54 
 
 
187 aa  229  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  57.54 
 
 
187 aa  229  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  57.54 
 
 
187 aa  230  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  56.98 
 
 
181 aa  228  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  56.98 
 
 
187 aa  228  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  56.42 
 
 
181 aa  227  9e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  56.99 
 
 
187 aa  226  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  55.87 
 
 
181 aa  226  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  53.63 
 
 
181 aa  216  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  57.14 
 
 
193 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  54.8 
 
 
193 aa  209  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  51.1 
 
 
184 aa  208  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  52.81 
 
 
185 aa  200  9e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  48.62 
 
 
181 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  52.3 
 
 
185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  53.53 
 
 
199 aa  192  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  50.55 
 
 
210 aa  184  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  50.56 
 
 
184 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  51.11 
 
 
182 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  50.56 
 
 
182 aa  174  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  46.43 
 
 
182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  46.15 
 
 
182 aa  167  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  44.94 
 
 
181 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  43.58 
 
 
181 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  42.78 
 
 
207 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  45.25 
 
 
180 aa  156  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  48.31 
 
 
190 aa  154  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  52.81 
 
 
182 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  52.25 
 
 
182 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  51.11 
 
 
182 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1247  isochorismatase hydrolase  48.31 
 
 
190 aa  134  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.127255  normal  0.527652 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  39.66 
 
 
203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  41.9 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  39.11 
 
 
211 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  39.11 
 
 
211 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  42.6 
 
 
196 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  38.64 
 
 
316 aa  127  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  42.6 
 
 
196 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  39.11 
 
 
203 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  42.6 
 
 
196 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0235  isochorismatase hydrolase  40.78 
 
 
316 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.809907 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  42.94 
 
 
201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  40.85 
 
 
313 aa  124  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  38.55 
 
 
203 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  40.56 
 
 
200 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  39.77 
 
 
196 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  37.64 
 
 
228 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  39.11 
 
 
198 aa  119  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  36.87 
 
 
289 aa  118  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  46.78 
 
 
199 aa  117  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  46.2 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  37.79 
 
 
223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 
231 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 
231 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 
231 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  44.19 
 
 
199 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  36.72 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  34.64 
 
 
231 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  39.16 
 
 
196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  37.7 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  36.93 
 
 
186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  46.2 
 
 
199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  40.46 
 
 
199 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  40.46 
 
 
199 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  40.46 
 
 
199 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  42.78 
 
 
199 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5247  isochorismatase hydrolase  44.05 
 
 
196 aa  105  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  33.33 
 
 
182 aa  105  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  36 
 
 
185 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  36.05 
 
 
198 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  33.89 
 
 
185 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  35.47 
 
 
198 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 
196 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  32.78 
 
 
184 aa  101  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  37.5 
 
 
177 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 
190 aa  99.8  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  35.88 
 
 
202 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  43.85 
 
 
199 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0975  isochorismatase hydrolase  37.65 
 
 
172 aa  99.4  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.8451  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  35.16 
 
 
191 aa  99  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  40 
 
 
197 aa  98.6  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  32.78 
 
 
184 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  41.38 
 
 
185 aa  97.8  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  44.62 
 
 
200 aa  97.8  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  36.14 
 
 
196 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  32.22 
 
 
184 aa  97.1  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  32.22 
 
 
184 aa  97.1  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  32.97 
 
 
193 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 
234 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  36.11 
 
 
212 aa  95.1  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  32.57 
 
 
342 aa  94.7  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  34.3 
 
 
359 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  31.67 
 
 
184 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  32.22 
 
 
185 aa  94.4  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  32.62 
 
 
193 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  38.37 
 
 
198 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.202745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>