More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1800 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
374 aa  783    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.86 
 
 
373 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.18 
 
 
380 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.38 
 
 
372 aa  558  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.92 
 
 
372 aa  560  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  70.49 
 
 
370 aa  559  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  68.29 
 
 
371 aa  545  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.12 
 
 
373 aa  511  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.45 
 
 
355 aa  480  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.05 
 
 
373 aa  471  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.34 
 
 
375 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.61 
 
 
374 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.05 
 
 
370 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.2 
 
 
395 aa  441  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.07 
 
 
370 aa  434  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.92 
 
 
380 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.28 
 
 
380 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.1 
 
 
370 aa  437  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.31 
 
 
373 aa  435  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.52 
 
 
386 aa  435  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.79 
 
 
379 aa  434  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.79 
 
 
379 aa  434  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.42 
 
 
373 aa  437  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.65 
 
 
379 aa  431  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.3 
 
 
377 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.08 
 
 
379 aa  433  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.73 
 
 
407 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.8 
 
 
379 aa  431  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.26 
 
 
379 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.26 
 
 
379 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.4 
 
 
369 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.26 
 
 
379 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.26 
 
 
379 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.26 
 
 
379 aa  429  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.01 
 
 
379 aa  429  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.26 
 
 
379 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.26 
 
 
379 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.26 
 
 
379 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.26 
 
 
379 aa  429  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.27 
 
 
372 aa  429  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.47 
 
 
371 aa  430  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.17 
 
 
369 aa  428  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.37 
 
 
379 aa  425  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.43 
 
 
371 aa  421  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.24 
 
 
375 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.87 
 
 
367 aa  421  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.97 
 
 
372 aa  421  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.68 
 
 
382 aa  421  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1290  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.68 
 
 
375 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3520  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.62 
 
 
377 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1241  normal  0.323798 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  54.67 
 
 
371 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14600  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.62 
 
 
372 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.89 
 
 
380 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.32 
 
 
383 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.32 
 
 
383 aa  418  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.29 
 
 
382 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.62 
 
 
380 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40480  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.62 
 
 
371 aa  416  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.07 
 
 
392 aa  413  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4621  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.34 
 
 
377 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.559921 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1321  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.41 
 
 
391 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.39 
 
 
383 aa  411  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.65 
 
 
374 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  0.0000118913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.65 
 
 
374 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000328041  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1215  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.96 
 
 
385 aa  414  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.557932 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.89 
 
 
372 aa  413  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4345  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.34 
 
 
377 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000330572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.65 
 
 
374 aa  412  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000652098  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.08 
 
 
375 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.08 
 
 
375 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0833  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.79 
 
 
371 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  0.0233256 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.02 
 
 
370 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0876  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.79 
 
 
377 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.321375 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  55.08 
 
 
375 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1413  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.07 
 
 
371 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.786795  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.08 
 
 
375 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.34 
 
 
377 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.293358  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.7 
 
 
384 aa  411  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1333  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.73 
 
 
370 aa  409  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.299331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.08 
 
 
375 aa  409  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2542  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.03 
 
 
387 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.213207  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2346  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.4 
 
 
376 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.395355  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.52 
 
 
370 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2394  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.7 
 
 
367 aa  409  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.311868  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.08 
 
 
375 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2944  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.46 
 
 
376 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.08 
 
 
375 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0863  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.79 
 
 
377 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1315  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.26 
 
 
376 aa  409  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.08 
 
 
375 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.08 
 
 
375 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.66 
 
 
369 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.85 
 
 
387 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2352  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.9 
 
 
391 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0280  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.65 
 
 
375 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.11 
 
 
374 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2787  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.37 
 
 
374 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000135544  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1570  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.37 
 
 
374 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000109087  hitchhiker  0.000000108069 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2647  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.2 
 
 
381 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000956702  hitchhiker  0.00180241 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2193  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.08 
 
 
374 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0616046  normal  0.0257357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>