More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1748 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  77.23 
 
 
416 aa  661  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  85.16 
 
 
415 aa  732  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.67671e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
413 aa  848  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  84.43 
 
 
415 aa  729  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  81.27 
 
 
415 aa  710  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  81.27 
 
 
415 aa  711  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  84.43 
 
 
415 aa  728  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  82.24 
 
 
415 aa  712  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  71.78 
 
 
412 aa  592  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  72.26 
 
 
412 aa  590  1e-167  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  66.99 
 
 
415 aa  583  1e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  68.55 
 
 
410 aa  577  1e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2432  serine hydroxymethyltransferase  72.68 
 
 
412 aa  577  1e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139104  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  68.3 
 
 
410 aa  573  1e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0064  serine hydroxymethyltransferase  70.32 
 
 
412 aa  572  1e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  66.42 
 
 
412 aa  568  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  66.26 
 
 
418 aa  568  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  66.42 
 
 
412 aa  568  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  66.18 
 
 
412 aa  570  1e-161  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  66.09 
 
 
412 aa  565  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  64.08 
 
 
412 aa  567  1e-160  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  66.26 
 
 
414 aa  566  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  67.32 
 
 
412 aa  565  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  65.53 
 
 
412 aa  565  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  70.05 
 
 
414 aa  563  1e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  64.72 
 
 
411 aa  564  1e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  66.59 
 
 
413 aa  559  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  3.58223e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  66.34 
 
 
413 aa  558  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.29833e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  67.07 
 
 
411 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  7.28494e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  62.93 
 
 
414 aa  560  1e-158  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 
414 aa  558  1e-158  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  66.34 
 
 
413 aa  558  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  66.34 
 
 
413 aa  558  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  3.38182e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  66.59 
 
 
413 aa  559  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  3.15106e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  66.83 
 
 
414 aa  558  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  4.68931e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  66.58 
 
 
414 aa  557  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  66.34 
 
 
413 aa  556  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  65.85 
 
 
420 aa  557  1e-157  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  65.69 
 
 
417 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  66.59 
 
 
413 aa  556  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  65.85 
 
 
413 aa  554  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  5.94889e-09  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  65.45 
 
 
413 aa  555  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  66.58 
 
 
414 aa  557  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  66.5 
 
 
417 aa  552  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.0982e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  66.1 
 
 
420 aa  553  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  61.8 
 
 
415 aa  551  1e-156  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  65.2 
 
 
417 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  63.41 
 
 
412 aa  553  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  65.2 
 
 
417 aa  554  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  64.86 
 
 
417 aa  548  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  64.72 
 
 
419 aa  548  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  5.84892e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  63.29 
 
 
424 aa  548  1e-155  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  65.93 
 
 
413 aa  547  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 
412 aa  543  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 
417 aa  538  1e-152  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  63.35 
 
 
419 aa  540  1e-152  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  62.93 
 
 
417 aa  538  1e-152  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  62.93 
 
 
417 aa  538  1e-152  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  62.93 
 
 
417 aa  538  1e-152  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  64.25 
 
 
427 aa  538  1e-152  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  62.93 
 
 
417 aa  539  1e-152  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  64.25 
 
 
427 aa  539  1e-152  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  62.93 
 
 
417 aa  539  1e-152  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  67.72 
 
 
415 aa  538  1e-152  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  64.3 
 
 
429 aa  540  1e-152  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  63.14 
 
 
422 aa  535  1e-151  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  63.9 
 
 
417 aa  537  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 
417 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 
417 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 
417 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  63.9 
 
 
422 aa  536  1e-151  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  63.02 
 
 
417 aa  536  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  62.1 
 
 
416 aa  536  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 
417 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 
417 aa  537  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  64.3 
 
 
431 aa  535  1e-151  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  63.66 
 
 
417 aa  532  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  63.64 
 
 
414 aa  532  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  63.73 
 
 
417 aa  533  1e-150  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  63.64 
 
 
414 aa  532  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  63.57 
 
 
417 aa  534  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  61.56 
 
 
417 aa  532  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  62.84 
 
 
417 aa  529  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  63.66 
 
 
417 aa  528  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  62.35 
 
 
438 aa  528  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  62.84 
 
 
415 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  62.84 
 
 
415 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  62.84 
 
 
415 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  62.84 
 
 
415 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  62.84 
 
 
415 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1851  serine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 
417 aa  528  1e-149  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  63.57 
 
 
417 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  62.35 
 
 
415 aa  528  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  62.59 
 
 
415 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1912  serine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 
430 aa  531  1e-149  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  62.84 
 
 
415 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  62.38 
 
 
415 aa  528  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  62.84 
 
 
415 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  62.41 
 
 
423 aa  527  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  62.53 
 
 
416 aa  528  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0832592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>