More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1727 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  74.94 
 
 
438 aa  686    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  71.85 
 
 
440 aa  680    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  76.2 
 
 
439 aa  712    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  71.33 
 
 
441 aa  682    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  71.62 
 
 
440 aa  677    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  72.32 
 
 
449 aa  685    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  100 
 
 
448 aa  920    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  62.39 
 
 
439 aa  560  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  53.56 
 
 
444 aa  466  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  51.03 
 
 
446 aa  466  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  53.09 
 
 
438 aa  464  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  50.23 
 
 
440 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  51.26 
 
 
436 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  51.03 
 
 
436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  51.03 
 
 
436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  51.03 
 
 
436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  51.03 
 
 
436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  51.03 
 
 
436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  51.03 
 
 
436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  51.61 
 
 
436 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  51.03 
 
 
436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  51.03 
 
 
436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  50.23 
 
 
438 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  50.23 
 
 
438 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  51.84 
 
 
436 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  50.23 
 
 
441 aa  450  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  50.57 
 
 
436 aa  450  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  50.11 
 
 
436 aa  448  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  51.15 
 
 
436 aa  445  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  49.66 
 
 
443 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  49.08 
 
 
439 aa  442  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  47.71 
 
 
438 aa  437  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  47.96 
 
 
440 aa  438  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2390  GTP-binding protein EngA  50.23 
 
 
441 aa  435  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149599  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  50.92 
 
 
441 aa  438  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1532  GTP-binding protein EngA  50.23 
 
 
436 aa  433  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1562  GTP-binding protein EngA  50.23 
 
 
436 aa  433  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.496113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  49.54 
 
 
439 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0799  GTP-binding protein EngA  48.05 
 
 
436 aa  426  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.940642  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  47.59 
 
 
436 aa  425  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1620  GTP-binding protein EngA  47.36 
 
 
436 aa  422  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  50.11 
 
 
441 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  47.94 
 
 
437 aa  422  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  47.36 
 
 
436 aa  422  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  47.46 
 
 
493 aa  420  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  47.95 
 
 
440 aa  420  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  46.26 
 
 
440 aa  421  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2134  GTP-binding protein EngA  45.5 
 
 
458 aa  412  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0583205  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  47.87 
 
 
449 aa  411  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  47.53 
 
 
494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  46 
 
 
448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  45.85 
 
 
438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0893  GTP-binding protein EngA  47.27 
 
 
427 aa  403  1e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177025  hitchhiker  0.0000000000000146029 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1654  GTP-binding protein EngA  45.87 
 
 
465 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2292  GTP-binding protein EngA  45 
 
 
465 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0406895  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  46.67 
 
 
438 aa  394  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2204  GTP-binding protein EngA  45 
 
 
465 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3568  GTP-binding protein EngA  44.02 
 
 
455 aa  393  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1009  GTPase  45.93 
 
 
442 aa  393  1e-108  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  44.76 
 
 
495 aa  392  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  44.6 
 
 
441 aa  387  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  44.83 
 
 
441 aa  388  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  45.29 
 
 
442 aa  385  1e-106  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2155  GTP-binding protein EngA  44.03 
 
 
471 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.616734  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03881  GTP-binding protein EngA  43.34 
 
 
456 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0644  GTP-binding protein EngA  43.61 
 
 
455 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2028  GTP-binding protein EngA  43.57 
 
 
455 aa  383  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.89204  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  44.72 
 
 
452 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  44.72 
 
 
452 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0333  GTP-binding protein EngA  44.89 
 
 
453 aa  382  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2340  GTP-binding protein EngA  45.7 
 
 
453 aa  379  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160254  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3566  ribosome-associated GTPase EngA  43.48 
 
 
454 aa  377  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.173152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1561  GTP-binding protein EngA  43.15 
 
 
453 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.53751  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0577  GTP-binding protein EngA  42.07 
 
 
435 aa  378  1e-103  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.416412  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0885  GTP-binding protein EngA  43.45 
 
 
452 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2896  GTP-binding protein EngA  43.81 
 
 
453 aa  375  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0739755  hitchhiker  0.000158888 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1614  GTP-binding protein EngA  43.45 
 
 
499 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106208 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21511  GTP-binding protein EngA  42.89 
 
 
461 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  44.42 
 
 
434 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl199  GTP-binding protein EngA  43.54 
 
 
435 aa  371  1e-101  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.316366  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4633  GTP-binding protein EngA  40.57 
 
 
511 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0426  GTP-binding protein EngA  42.89 
 
 
442 aa  371  1e-101  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000271389  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2082  GTP-binding protein EngA  45.79 
 
 
447 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543675  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2537  GTP-binding protein EngA  45.08 
 
 
445 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358302  hitchhiker  0.0000595621 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1598  GTP-binding protein EngA  44.62 
 
 
445 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111864  normal  0.122269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1879  GTP-binding protein EngA  44.34 
 
 
437 aa  364  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1746  GTP-binding protein EngA  44.59 
 
 
445 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1719  GTP-binding protein EngA  44.59 
 
 
445 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.576586 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  44.59 
 
 
445 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  44.27 
 
 
467 aa  364  2e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  44.59 
 
 
445 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  44.59 
 
 
445 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02977  GTP-binding protein EngA  43.91 
 
 
481 aa  362  6e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3778  small GTP-binding protein  41.15 
 
 
433 aa  362  8e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0916  small GTP-binding protein  39.72 
 
 
439 aa  361  1e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.704291  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  42.89 
 
 
490 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2238  GTP-binding protein EngA  44.39 
 
 
445 aa  360  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.746998  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2223  GTP-binding protein EngA  44.62 
 
 
445 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0066  GTP-binding protein EngA  44.62 
 
 
445 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225046  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1102  GTP-binding protein EngA  44.62 
 
 
445 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>