More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1702 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  66.95 
 
 
462 aa  639    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  65.86 
 
 
457 aa  650    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  67.6 
 
 
606 aa  644    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  67.6 
 
 
462 aa  653    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  100 
 
 
461 aa  942    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  64.55 
 
 
458 aa  609  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  63.68 
 
 
458 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  55.87 
 
 
464 aa  533  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  40.82 
 
 
459 aa  353  4e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  37.83 
 
 
454 aa  337  1.9999999999999998e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  44.44 
 
 
256 aa  250  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0877  Radical SAM domain protein  63.54 
 
 
210 aa  250  4e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  46.09 
 
 
257 aa  244  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  46.67 
 
 
257 aa  243  7e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  42.97 
 
 
255 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  43.53 
 
 
256 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  42.58 
 
 
255 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  42.58 
 
 
255 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  46.09 
 
 
256 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  42.58 
 
 
255 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  42.58 
 
 
255 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  42.19 
 
 
255 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  42.19 
 
 
255 aa  237  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  45.1 
 
 
255 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  42.19 
 
 
255 aa  236  7e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  41.8 
 
 
255 aa  236  7e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  42.19 
 
 
255 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  41.8 
 
 
255 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  42.19 
 
 
255 aa  233  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  42.58 
 
 
256 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  43.31 
 
 
253 aa  229  7e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  45.56 
 
 
258 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  41.8 
 
 
256 aa  226  6e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  39.61 
 
 
255 aa  226  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  46.43 
 
 
261 aa  224  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  46.46 
 
 
261 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  41.57 
 
 
251 aa  222  9e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  44.27 
 
 
264 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  47.24 
 
 
256 aa  220  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  45.74 
 
 
258 aa  220  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  45.74 
 
 
258 aa  220  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  44.44 
 
 
256 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  47.86 
 
 
256 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  44.4 
 
 
271 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  45.31 
 
 
258 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  40.32 
 
 
256 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  40.32 
 
 
256 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  43.36 
 
 
257 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  41.63 
 
 
257 aa  213  5.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  41.63 
 
 
257 aa  213  5.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  43.08 
 
 
268 aa  212  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  41.96 
 
 
268 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  38.49 
 
 
256 aa  211  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  40.15 
 
 
263 aa  211  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  43.14 
 
 
264 aa  211  3e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2068  TatD-related deoxyribonuclease  43.89 
 
 
262 aa  209  7e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  38.89 
 
 
255 aa  209  8e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  40.15 
 
 
267 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  43.19 
 
 
255 aa  209  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04351  putative deoxyribonuclease, TatD family  44.4 
 
 
277 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  41.5 
 
 
273 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0800  TatD family hydrolase  39.37 
 
 
274 aa  208  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  43.41 
 
 
264 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  37.3 
 
 
256 aa  207  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0185  TatD family hydrolase  42.13 
 
 
278 aa  207  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  42.91 
 
 
257 aa  207  5e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  39.45 
 
 
256 aa  206  7e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  42.75 
 
 
259 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16081  TatD family deoxyribonuclease  39.53 
 
 
261 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  38.17 
 
 
263 aa  203  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  42.91 
 
 
259 aa  203  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  43.31 
 
 
258 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0074  TatD-related deoxyribonuclease  39.69 
 
 
276 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  38.76 
 
 
273 aa  199  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  41.86 
 
 
258 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  38.1 
 
 
253 aa  197  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0604  TatD-related deoxyribonuclease  41.6 
 
 
262 aa  196  7e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  40.23 
 
 
265 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  42.02 
 
 
264 aa  196  9e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  35.11 
 
 
262 aa  194  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  39.61 
 
 
270 aa  193  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  39.84 
 
 
255 aa  194  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  44.66 
 
 
257 aa  194  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  39.22 
 
 
262 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001920  deoxyribonuclease TatD  38.43 
 
 
253 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  39.84 
 
 
263 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3003  TatD related DNase  37.8 
 
 
265 aa  192  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0100671  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00569  deoxyribonuclease  38.82 
 
 
254 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  37.74 
 
 
255 aa  190  5e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  36.9 
 
 
251 aa  190  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  34.52 
 
 
260 aa  189  9e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  40.78 
 
 
269 aa  189  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  37.35 
 
 
255 aa  189  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  39.13 
 
 
254 aa  188  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  38.98 
 
 
267 aa  187  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0780  hydrolase, TatD family  38.67 
 
 
273 aa  187  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  40.08 
 
 
257 aa  187  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  36.47 
 
 
259 aa  187  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  38.28 
 
 
255 aa  186  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0489  hydrolase, TatD family  39.33 
 
 
281 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.868901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>