295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1639 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 359 aa  716    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  57.98 
 
 		 359 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  48.74 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  48.18 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  43.58 
 
 		 359 aa  334  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  45.28 
 
 		 360 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  44.17 
 
 		 360 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  37.11 
 
 		 362 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  33.05 
 
 		 359 aa  182  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  30.25 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  28.05 
 
 		 359 aa  149  8e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  26.63 
 
 		 360 aa  145  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  26.12 
 
 		 792 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  25.71 
 
 		 387 aa  132  6.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  25.28 
 
 		 365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  28.3 
 
 		 371 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 359 aa  127  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  26.61 
 
 		 360 aa  124  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  27.48 
 
 		 356 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  24.51 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  30.3 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  26.45 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 358 aa  106  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  28.62 
 
 		 1040 aa  106  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  25.53 
 
 		 374 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  26.18 
 
 		 359 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  22.25 
 
 		 356 aa  99.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  26.52 
 
 		 366 aa  97.4  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  24.17 
 
 		 356 aa  97.1  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  22.25 
 
 		 356 aa  97.1  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  22.88 
 
 		 358 aa  96.7  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  23.01 
 
 		 358 aa  96.3  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  25.91 
 
 		 391 aa  96.3  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  24.51 
 
 		 356 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  24.07 
 
 		 434 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  23.91 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  26.45 
 
 		 360 aa  95.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  25.5 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  26.56 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 364 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  26.27 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  25.07 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  26.67 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3066  permease YjgP/YjgQ family protein  25.16 
 
 		 355 aa  91.3  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.326563 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  22.53 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  20.89 
 
 		 362 aa  90.9  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  23.9 
 
 		 367 aa  91.3  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  23.71 
 
 		 358 aa  90.5  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  26.72 
 
 		 353 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  21.53 
 
 		 360 aa  88.6  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  24.53 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1424  permease YjgP/YjgQ family protein  23.73 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  25.21 
 
 		 355 aa  87.8  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  25.64 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  28.16 
 
 		 350 aa  86.7  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0375  permease YjgP/YjgQ family protein  26.61 
 
 		 361 aa  85.9  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0887769 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  25.51 
 
 		 382 aa  85.9  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  24.79 
 
 		 362 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  23.55 
 
 		 362 aa  85.5  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  27.56 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  22.92 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3075  permease YjgP/YjgQ  25.36 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20702  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  22.57 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  27.21 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  24.78 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  23.36 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  20.34 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  23.85 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  24.71 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  23.6 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465141 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  25.57 
 
 		 357 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4009  permease YjgP/YjgQ family protein  24.85 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.604815 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  26.69 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1230  permease YjgP/YjgQ family protein  23.77 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494831  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  24.77 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  25.53 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  24.01 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0948  permease YjgP/YjgQ  24.11 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.046524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  23.14 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  25.59 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  23.37 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  26.79 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  20.96 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  25.42 
 
 		 355 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  25.82 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  23.98 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2744  permease YjgP/YjgQ family protein  24.65 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  26.42 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3472  permease YjgP/YjgQ family protein  23.63 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  26.58 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1189  permease YjgP/YjgQ family protein  24.65 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216183  normal  0.433432 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  24.06 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  21.84 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  23.88 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  25 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  24.79 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  25.61 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02804  hypothetical protein  23.92 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000115691  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  21.33 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  25.14 
 
 		 355 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>