More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1622 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 775 aa  1590    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  44.53 
 
 		 536 aa  318  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  36.42 
 
 		 794 aa  300  7e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1149  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 833 aa  292  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355741  normal  0.205094 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0273  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 917 aa  290  8e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.161492 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.07 
 
 		 1019 aa  289  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  41.42 
 
 		 642 aa  283  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  41.38 
 
 		 642 aa  281  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  42.94 
 
 		 637 aa  280  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  40.33 
 
 		 410 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0911  sensory box histidine kinase  38.23 
 
 		 581 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 1246 aa  273  9e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0052  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 		 1054 aa  272  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0350  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.26 
 
 		 1140 aa  271  5e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2075  signal transduction protein  34.35 
 
 		 988 aa  269  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  42.18 
 
 		 649 aa  266  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1858  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 		 1191 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  45.1 
 
 		 862 aa  262  2e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1041  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.74 
 
 		 1121 aa  261  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.700011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  50.39 
 
 		 1079 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1870  histidine kinase  35.56 
 
 		 779 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0926  sensory box protein  34.22 
 
 		 1063 aa  254  5.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1509  diguanylate cyclase  39.07 
 
 		 835 aa  252  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0192657  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  50 
 
 		 1087 aa  252  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  50.6 
 
 		 1100 aa  252  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  49.6 
 
 		 1087 aa  249  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  39.73 
 
 		 637 aa  248  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3233  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 		 1151 aa  248  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.885558  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  38.28 
 
 		 684 aa  245  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.66 
 
 		 916 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3113  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 962 aa  238  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1831  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 793 aa  238  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.836817  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  37.46 
 
 		 758 aa  237  6e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  46.13 
 
 		 1083 aa  232  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  36.8 
 
 		 882 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.28 
 
 		 1309 aa  228  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  46.84 
 
 		 366 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3101  hypothetical protein  34.95 
 
 		 757 aa  227  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  45.06 
 
 		 1082 aa  227  8e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1088  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.48 
 
 		 822 aa  225  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.436726 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  41.76 
 
 		 853 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 		 898 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1837  diguanylate cyclase  33.04 
 
 		 544 aa  216  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.980403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2138  metal dependent phosphohydrolase  32.98 
 
 		 606 aa  211  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.258694  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  33.05 
 
 		 754 aa  205  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 842 aa  201  6e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3102  GGDEF domain-containing protein  33.23 
 
 		 580 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1273  PAS sensor protein  28.14 
 
 		 728 aa  196  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 868 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.371238 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0626  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.8 
 
 		 856 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3419  sensor histidine kinase  28.88 
 
 		 774 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  40 
 
 		 396 aa  179  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  63.57 
 
 		 637 aa  179  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3914  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.18 
 
 		 918 aa  178  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.161625  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001950  sensory box/GGDEF family protein  27.67 
 
 		 1041 aa  177  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2313  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.08 
 
 		 981 aa  177  9e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.762814  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.13 
 
 		 802 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43493  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0591  putative membrane associated signaling protein  27.32 
 
 		 596 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00528  hypothetical protein  32.98 
 
 		 1049 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 		 1101 aa  173  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1847  histidine kinase  33.33 
 
 		 785 aa  172  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2366  two component sensor histidine kinase  26.9 
 
 		 1154 aa  172  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0469089  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1424  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 		 1050 aa  171  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4662  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0677  sensory box/GGDEF family protein  26.28 
 
 		 947 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000825914  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.55 
 
 		 563 aa  163  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  34.57 
 
 		 706 aa  158  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  36.47 
 
 		 708 aa  159  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  28.29 
 
 		 409 aa  154  8e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.59 
 
 		 961 aa  153  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.44 
 
 		 482 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  35.45 
 
 		 469 aa  152  3e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  30 
 
 		 474 aa  152  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.24 
 
 		 832 aa  150  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  34.36 
 
 		 477 aa  150  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  32.42 
 
 		 463 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2005  ATP-binding region ATPase domain protein  24.81 
 
 		 617 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.144674  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  34.55 
 
 		 455 aa  149  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  35.8 
 
 		 470 aa  148  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0011  serine phosphatase  33.07 
 
 		 447 aa  148  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.893308  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0859  metal dependent phosphohydrolase  31.15 
 
 		 685 aa  147  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.55284  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.27 
 
 		 447 aa  147  6e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 648 aa  147  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  30.98 
 
 		 460 aa  146  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.87 
 
 		 447 aa  145  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.76 
 
 		 945 aa  145  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.34 
 
 		 1332 aa  145  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.58 
 
 		 1088 aa  144  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.38 
 
 		 467 aa  144  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0053  two component sensor histidine kinase  27.73 
 
 		 867 aa  144  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  32.64 
 
 		 364 aa  143  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  35.95 
 
 		 361 aa  143  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.75 
 
 		 957 aa  143  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.29 
 
 		 465 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.38 
 
 		 773 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  34.29 
 
 		 465 aa  142  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.27 
 
 		 423 aa  142  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  36.78 
 
 		 365 aa  142  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.72 
 
 		 507 aa  141  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  32.05 
 
 		 612 aa  141  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  32.23 
 
 		 451 aa  140  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>