More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1600 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  100 
 
 		 171 aa  345  3e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  61.54 
 
 		 178 aa  204  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  62.09 
 
 		 164 aa  202  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  59.48 
 
 		 163 aa  202  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  64.54 
 
 		 169 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  58.55 
 
 		 167 aa  195  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  59.21 
 
 		 157 aa  192  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  59.31 
 
 		 164 aa  190  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  56.05 
 
 		 164 aa  189  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  57.45 
 
 		 164 aa  189  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  55.62 
 
 		 162 aa  189  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  53.21 
 
 		 164 aa  187  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  58.62 
 
 		 164 aa  186  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  51.23 
 
 		 185 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  51.23 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  52.67 
 
 		 181 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  54.79 
 
 		 161 aa  168  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  50.64 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  51.25 
 
 		 163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  46.95 
 
 		 179 aa  160  7e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  47.33 
 
 		 167 aa  157  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  46.9 
 
 		 164 aa  157  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  50.68 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  49.31 
 
 		 194 aa  150  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  47.92 
 
 		 194 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  47.22 
 
 		 192 aa  147  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  45.14 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  45.64 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  45.03 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  44.37 
 
 		 179 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  42 
 
 		 187 aa  137  7e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  39.74 
 
 		 185 aa  136  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  42.95 
 
 		 180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  42.03 
 
 		 179 aa  131  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  41.5 
 
 		 184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  40.4 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  41.03 
 
 		 162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  39.75 
 
 		 160 aa  124  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  40.71 
 
 		 176 aa  124  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  40.43 
 
 		 159 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1400  CheW protein  36.71 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  38.12 
 
 		 194 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  39.38 
 
 		 194 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  41.33 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  38.51 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  41.06 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  38.93 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  39.29 
 
 		 169 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  40.94 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  44.85 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  39.73 
 
 		 171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  39.61 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6732  CheW protein  37.84 
 
 		 165 aa  117  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0258565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.26 
 
 		 164 aa  117  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.42 
 
 		 178 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.58 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  39.04 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  36.88 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  37.58 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  37.58 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  37.58 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  37.58 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  37.58 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.73 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  37.58 
 
 		 212 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  39.73 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  39.73 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  37.58 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  37.58 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  39.73 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  37.58 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  37.58 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  37.58 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  41.01 
 
 		 187 aa  114  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  37.58 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  37.58 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  37.58 
 
 		 163 aa  114  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  41.04 
 
 		 162 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  41.26 
 
 		 205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3558  CheW protein  39.73 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911694  normal  0.981486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  41.04 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  42.75 
 
 		 191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  38.46 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.26 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  39.58 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  36.24 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  42.75 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  37.67 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  37.58 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  37.58 
 
 		 159 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  36.13 
 
 		 167 aa  111  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  37.58 
 
 		 164 aa  110  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  36.91 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  37.58 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  40 
 
 		 163 aa  110  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  37.5 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  35.4 
 
 		 175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  36.91 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  35.06 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  39.86 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>