More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1524 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1524  benzoate-CoA ligase family  100 
 
 		 503 aa  1010    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3360  benzoate-CoA ligase family  56.32 
 
 		 505 aa  551  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2397  benzoate-CoA ligase family  52.8 
 
 		 501 aa  514  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2633  benzoate-CoA ligase family  44.6 
 
 		 513 aa  412  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.710066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2983  benzoate-CoA ligase  42.97 
 
 		 528 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197545  normal  0.494918 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1759  benzoate-CoA ligase  42.32 
 
 		 527 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00396412  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1419  benzoate-coenzyme A ligase  43 
 
 		 530 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2700  benzoate-CoA ligase family  41.55 
 
 		 530 aa  364  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1543  benzoate-CoA ligase family  41.22 
 
 		 532 aa  360  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.495782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2143  benzoate-CoA ligase family  39.84 
 
 		 523 aa  360  4e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0896  benzoate-coenzyme A ligase  41.8 
 
 		 531 aa  353  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310477 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1224  benzoate-CoA ligase  40.67 
 
 		 549 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231141  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3136  benzoate-CoA ligase family  41.78 
 
 		 528 aa  351  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0730  benzoate-CoA ligase family  40.94 
 
 		 519 aa  348  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1327  benzoate-CoA ligase  41.17 
 
 		 553 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618655  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2825  benzoate-CoA ligase family  38.51 
 
 		 519 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1534  benzoate-CoA ligase family  40.62 
 
 		 524 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0829  benzoate-CoA ligase  41.29 
 
 		 521 aa  329  6e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0973123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4656  benzoate-CoA ligase family  39.33 
 
 		 517 aa  326  6e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0728  benzoate-CoA ligase family  40.04 
 
 		 524 aa  326  7e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0669  benzoate-CoA ligase family  39.09 
 
 		 503 aa  325  8.000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0089  benzoate-CoA ligase family  41.02 
 
 		 515 aa  324  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0076  benzoate-CoA ligase family  40.28 
 
 		 518 aa  321  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0878  benzoate-CoA ligase family  38.31 
 
 		 518 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36254  normal  0.31927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0747  putative AMP-dependent synthetase and ligase  38.81 
 
 		 506 aa  322  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1016  benzoate-CoA ligase family  36.67 
 
 		 521 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1624  benzoate-CoA ligase  39.84 
 
 		 526 aa  319  9e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1025  benzoate-CoA ligase family  39.3 
 
 		 524 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2948  benzoate-CoA ligase family  39.72 
 
 		 527 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178077  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1526  benzoate-CoA ligase family  35.9 
 
 		 520 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.936301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2828  benzoate-CoA ligase family  34.12 
 
 		 525 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0216  benzoate-CoA ligase family  38.67 
 
 		 532 aa  306  6e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6637  benzoate-coenzyme A ligase  38.48 
 
 		 533 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6534  benzoate-CoA ligase family  40 
 
 		 550 aa  303  5.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3655  benzoate-CoA ligase family  38.48 
 
 		 531 aa  300  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7498  putative AMP-dependent synthetase and ligase  36.72 
 
 		 537 aa  300  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.740274 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0736  benzoate-CoA ligase family  36.1 
 
 		 539 aa  299  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6948  benzoate-CoA ligase family  36.06 
 
 		 535 aa  290  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0172  benzoate-CoA ligase family  36.66 
 
 		 554 aa  289  7e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  35.25 
 
 		 542 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  37.25 
 
 		 546 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2279  AMP-dependent synthetase and ligase  37.3 
 
 		 543 aa  281  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2688  putative acid-thiol ligase  34.27 
 
 		 567 aa  279  9e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2116  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 		 539 aa  271  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.528716 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0589  benzoate-CoA ligase family  35.31 
 
 		 547 aa  269  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2198  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 		 553 aa  267  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153376  normal  0.142852 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5092  benzoate-CoA ligase family  33.9 
 
 		 541 aa  262  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6454  AMP-dependent synthetase and ligase  34.61 
 
 		 529 aa  259  9e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1765  AMP-dependent synthetase and ligase  35.1 
 
 		 514 aa  256  7e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459624  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4402  coenzyme A ligase  38.58 
 
 		 517 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02012  acetyl-coenzyme A synthetase  33.69 
 
 		 539 aa  253  8.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51430  coenzyme A ligase  36.51 
 
 		 517 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261985 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2688  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 		 546 aa  251  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7161  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 546 aa  250  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2238  AMP-dependent synthetase and ligase  34.96 
 
 		 538 aa  249  7e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.576533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5094  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 		 546 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 545 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0275  putative acid-coenzyme A ligase  33.53 
 
 		 546 aa  246  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5523  AMP-dependent synthetase and ligase  34.63 
 
 		 551 aa  246  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1328  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 		 539 aa  246  9e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.555965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  34.23 
 
 		 551 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 546 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5524  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 		 557 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2180  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 548 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5042  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 542 aa  241  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3175  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 		 539 aa  240  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0233351  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  32.85 
 
 		 538 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.464293 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3949  AMP-dependent synthetase and ligase  32.85 
 
 		 538 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.169877 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4003  benzoate-CoA ligase family  32.16 
 
 		 542 aa  238  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0147866  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1935  acetyl-CoA synthetase, putative  33.06 
 
 		 541 aa  230  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2033  2-aminobenzoate-CoA ligase  33.68 
 
 		 541 aa  230  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.951217  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4177  AMP-dependent synthetase and ligase  34.11 
 
 		 546 aa  230  5e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0653  2-aminobenzoate-CoA ligase  33.47 
 
 		 541 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 		 510 aa  227  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0744  2-aminobenzoate-CoA ligase  33.26 
 
 		 541 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12962  acyl-CoA synthetase  34.36 
 
 		 705 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1370  AMP-dependent synthetase and ligase  36.24 
 
 		 513 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31361  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 559 aa  217  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3763  benzoate-coenzyme A ligase  32.86 
 
 		 522 aa  216  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0336097  normal  0.403317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0875  AMP-dependent synthetase and ligase  35.28 
 
 		 517 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  30.94 
 
 		 500 aa  214  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 		 499 aa  212  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3231  AMP-dependent synthetase and ligase  30.64 
 
 		 534 aa  211  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000448213  normal  0.730696 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.66 
 
 		 500 aa  211  3e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1058  AMP-dependent synthetase and ligase  29.98 
 
 		 533 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.599602  normal  0.879487 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  32.94 
 
 		 522 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3664  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.95 
 
 		 532 aa  210  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  29.79 
 
 		 533 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2934  AMP-dependent synthetase and ligase  29.29 
 
 		 535 aa  209  9e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3087  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 		 526 aa  209  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.789973  normal  0.153239 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4971  AMP-dependent synthetase and ligase  29.41 
 
 		 556 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.212959 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0956  AMP-dependent synthetase and ligase  29.79 
 
 		 533 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.646193  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  30.96 
 
 		 561 aa  207  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3734  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.9 
 
 		 560 aa  207  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.862355  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3139  AMP-dependent synthetase and ligase  30.64 
 
 		 534 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000126557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.65 
 
 		 514 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 		 552 aa  207  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3334  AMP-dependent synthetase and ligase  29.59 
 
 		 533 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0892803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1593  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.15 
 
 		 558 aa  206  9e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  30.35 
 
 		 508 aa  205  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>