134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1495 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1495  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 234 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0619  response regulator receiver protein  73.08 
 
 		 234 aa  363  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2099  sensory box protein, putative  54.31 
 
 		 232 aa  278  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.374789  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0056  response regulator  40.43 
 
 		 235 aa  205  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1561  putative PAS/PAC sensor protein  28.22 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925231 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0028  CO metabolism transcriptional regulator RcoM2  26.21 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28119 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2142  CO metabolism transcriptional regulator RcoM  25.4 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2482  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.85 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5410  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.86 
 
 		 335 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000374039  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5461  ABC transporter, ATP-binding protein  31.86 
 
 		 335 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5376  ABC transporter, ATP-binding protein  31.86 
 
 		 335 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000218123 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4967  ABC transporter ATP-binding protein  31.86 
 
 		 335 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000811846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4985  ABC transporter, ATP-binding protein  31.86 
 
 		 335 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000703532  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5083  LytTr DNA-binding region  31.86 
 
 		 335 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000635558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5544  ABC transporter, ATP-binding protein  31.86 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000378765  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5134  ABC transporter ATP-binding protein, C-terminus  30.97 
 
 		 137 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5406  ABC transporter, ATP-binding protein  31.03 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.3143  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  33.33 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2542  putative PAS/PAC sensor protein  26.38 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.77 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3804  LytTr DNA-binding region  30.7 
 
 		 335 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3515  LytR/AlgR family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1246  LytTR family two component transcriptional regulator  23.91 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  32.11 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2673  ABC transporter related protein  28.7 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000800207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.36 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  28.57 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0252  two-component response regulator  28.57 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3427  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.96 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1209  putative integral membrane sensor protein  28.32 
 
 		 368 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131047  normal  0.490878 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0498  LytTR family two component transcriptional regulator  29.7 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022884  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2784  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.53 
 
 		 358 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1279  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.23 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2133  LytTR family two component transcriptional regulator  31.31 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2822  response regulator receiver domain-containing protein  32.41 
 
 		 304 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.135551  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2443  LytTR family two component transcriptional regulator  32.38 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07024  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2957  response regulator receiver protein  31.19 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00954821  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3599  response regulator receiver protein  24.11 
 
 		 373 aa  52.8  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.485961  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3172  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.18 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00901875  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0715  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.75 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00500528  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.11 
 
 		 253 aa  52.4  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  26.42 
 
 		 245 aa  52.4  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6324  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.91 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01905  response regulator  29.41 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2282  response regulator receiver protein  27.45 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.81  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.36 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0387  response regulator  33.68 
 
 		 261 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1994  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.22 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2098  putative integral membrane sensor protein  31.37 
 
 		 392 aa  50.1  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.096975  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000974  response regulator of the LytR/AlgR family  31.43 
 
 		 263 aa  50.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.728867  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2221  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 309 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4189  LytTr DNA-binding region  32.5 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0498  DNA-binding response regulator  27.66 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000794566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.42 
 
 		 246 aa  49.3  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0486  DNA-binding response regulator  28.12 
 
 		 238 aa  48.5  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0347807  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1621  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0036  LytR/AlgR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11470  response regulator of the LytR/AlgR family  31.87 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3167  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.19 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3159  response regulator receiver  28 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1746  carbon monoxide dehydrogenase, coxC signalling protein  27.78 
 
 		 410 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0357  response regulator receiver  30.53 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1844  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.58 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3405  LytTR family two component transcriptional regulator  31.52 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.732179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0421  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.77 
 
 		 256 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.33 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4801  two component transcriptional regulator, LytTR family  30 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2025  two-component response regulator  26.42 
 
 		 252 aa  46.2  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  26.58 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2762  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 254 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  normal  0.784413 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3613  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.43 
 
 		 281 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.18 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2171  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.59 
 
 		 249 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0294549  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0161  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 270 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  32.04 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  32.04 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  32.04 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1330  LytTR family two component transcriptional regulator  30.11 
 
 		 261 aa  45.4  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  hitchhiker  0.00674538 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.04 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1970  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 121 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.680735  hitchhiker  0.00000422854 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  32.04 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  32.04 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1148  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1645  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.83 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1069  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.27 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.257927  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0114  LytTR family two component transcriptional regulator  28.07 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.310837  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5278  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.18 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1879  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.07 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.247337  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1149  response regulator receiver protein  25.71 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1113  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.29087 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0795  LytTR family two component transcriptional regulator  27.54 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3483  LytTR family two component transcriptional regulator  31.76 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3686  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.33 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0033  DNA-binding response regulator  24.44 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00150761  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2259  putative two-component response-regulatory protein YehT  27.05 
 
 		 239 aa  42.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>